Re: [求救] 一個gene有三個很接近的isoform
※ 引述《anubis2 (寒風吹過我的心)》之銘言：
: 各位大大好
: 小的 目前在研究一個gene 它有三個很接近的isoform
: 分別為1 2650bp (mRNA 為580-2193 長度1613bp)
: 2 2073bp (mRNA 為12-1616 長度1604bp)
: 3 2060bp (mRNA 為55-1503 長度1448bp)
: 三個isoform的大小非常接近，而且做過序列比對，非常接近，只有一個部分有
: 約40bp的不同，所以無法從pcr 或 western 中分別出來
: 可是目前一定要解決就是 要知道那個isoform才是主要受到調控的部分
: 請教各位大大，要如何分辨誰是誰，誰的調控最高哩??
: 謝謝，感恩。
你的mRNA是指CDS的話
PCR 應該就可以吧
比如 1就有1000bp左右是UTR的部分應該會有不同於 2 3 的片段
至於 2 3 就找 找看有沒有不同的地方應該會有150bp左右的差異
isoform如果是alternative splicing 所造成的或許就會很難分
不過以這三個大小看來應該還可以分的開
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