Re: [問題] protein marker以及SDS-PAGE的band
不是修飾與否的問題
當然蛋白質的後修飾會造成理論值跟實際值的差異
但是原 po 問的是SDS 跑出來的結果是否 "幾乎必然" 跟計算不同
原 po 所持的理由是
"計算出來的是 native form 的分子量"
但
"SDS PAGE 跑出來的是 denature 的分子量"
上面的理由有有一個基本上的錯誤：
試問 "native form 的分子量" 跟 "denatured form 的分子量" 有何不同？
在 SDS PAGE 中，所謂 denature 指的是蛋白質二級以上結構的喪失
二級以上結構喪失會影響分子量嗎？
或者反過來想
當我們計算一蛋白質的理論分子量的時候 可曾需要考慮二級以上結構的影響嗎？
簡而言之 不管有沒有 denature, 分子量本身是不會變的
會變的是實驗的結果能否正確反應其分子量
在蛋白質電泳中 若不 denature 則反而不能反映正確的分子量
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And my soul from out that shadow that lies floating on the floor
在那地板上浮動的影子中的我的靈魂
Shall be lifted- nevermore!
將永不再起...
--The Raven by E.A.Poe
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