[求救] ligation 接不起來?

看板Biotech作者 (for the love of god)時間18年前 (2007/07/28 11:33), 編輯推噓4(401)
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大家好! 小弟有一問題想問 困擾我好久了T.T 我在clone一段2k 的promoter 序列 想把他接到5k的reporter vector 上 2k這insert先TA cloning 後 有用兩邊的primer 送過定序了 序列正確 且設計在primer 上兩邊的cutting site 也都有 然後想要把他接到5k的vector 上時就出現問題了 重做了一個多月 約四, 五 次了 每次接完 transform 抽mini RE check size 時 理論上要出現我的2k insert 與5k backbone 但每次出現都有"3K" 的 band !! 對 就是3k 每次都有!!! 這幾次出現的band 有過" 2k 3k" " 2k 3k 5k" " 2.2k 5k"這三種pattern 5k 跟2.2k(2~2.5k中間@@)的情形中 2.xk的band跟5k的比起來淡很多 有點怪 其它"2k 3k" 或 "2k 3k 5k" 的時後 所有的band 都是一樣亮的 本來想說會不會是混到TA cloning中的pGEMT vector( 正好是3k ) 但重試了很多次 應該不會每次都切的時後混到吧T.T 然後這些sample 送定序時 發現定回來的1k多序列全部都是我的5k backbone序列 代表完全沒有接進insert 那這樣子每次都出現的2k又是什麼 3k 又是什麼T.T 快想破頭腦了還是搞不懂 希望大哥大姐們能夠給小弟指點一點迷津啊 太感謝了!!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 218.166.111.127

07/28 13:03, , 1F
妳要不要用RE 去切vector only(5K那個) ?? 看有什麼情況
07/28 13:03, 1F

07/28 13:10, , 2F
你insert兩端的enzyme site,double digest的效率高嗎?
07/28 13:10, 2F

07/28 16:48, , 3F
to一樓 有呀 一開始就是vector兩邊切完後 跑膠萃取 再ligation
07/28 16:48, 3F

07/28 16:49, , 4F
to二樓 從TA上double digest下來 看起來還好啊 可以切@@??
07/28 16:49, 4F

08/01 15:46, , 5F
別做TA cloning 用direct cloning別浪費時間在TA clone上
08/01 15:46, 5F
文章代碼(AID): #16ghaEaT (Biotech)
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