[求救] ligation 接不起來?
大家好!
小弟有一問題想問 困擾我好久了T.T
我在clone一段2k 的promoter 序列 想把他接到5k的reporter vector 上
2k這insert先TA cloning 後 有用兩邊的primer 送過定序了 序列正確
且設計在primer 上兩邊的cutting site 也都有
然後想要把他接到5k的vector 上時就出現問題了
重做了一個多月 約四, 五 次了 每次接完 transform 抽mini
RE check size 時 理論上要出現我的2k insert 與5k backbone
但每次出現都有"3K" 的 band !! 對 就是3k 每次都有!!!
這幾次出現的band 有過" 2k 3k" " 2k 3k 5k" " 2.2k 5k"這三種pattern
5k 跟2.2k(2~2.5k中間@@)的情形中 2.xk的band跟5k的比起來淡很多 有點怪
其它"2k 3k" 或 "2k 3k 5k" 的時後 所有的band 都是一樣亮的
本來想說會不會是混到TA cloning中的pGEMT vector( 正好是3k )
但重試了很多次 應該不會每次都切的時後混到吧T.T
然後這些sample 送定序時 發現定回來的1k多序列全部都是我的5k backbone序列
代表完全沒有接進insert 那這樣子每次都出現的2k又是什麼 3k 又是什麼T.T
快想破頭腦了還是搞不懂
希望大哥大姐們能夠給小弟指點一點迷津啊 太感謝了!!!
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