Re: [問題] 生化考古題的簡單問題
※ 引述《gsuper (綠色蘇打心)》之銘言：
: : b.RR (DNA重組修復)
: RR通常是在處理double strand breaks
: 可以請問一下原po是在哪本書查到RR可以修復 UV-induced DNA lesion嗎??
: ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
: 我是看補習班老師
: 莊老師的講義自己整理出來的結果
: E.coli 在 DNA replication 時
: 會有兩種以上的RR
: 1.recBCD : 針對SSB在DNA複製的時候變成DSB 因而啟動 RR
: 2.recFOR : 針對DNA複製時的 DNA lesion
: 因為缺乏至少一股正常的 修復條件
: 一般的修復機制無法使用
: 所以利用另外一股子代
: 做reverse branch migration
: 先把正常的子代DNA做出來
: 再用子代DNA修復親代DNA
不必E coli，在human系統就是
UV lesion或進一步形成的nick在S期造成replication stalling
這時leading無法解開，但是lagging strand collapse引發DSB
這時候就與homologous recombination有關
: : c.DNA photolyase
: 這個也可以, 但是胎盤哺乳類(包括人類), 沒有這種酵素
: ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
: 人類好像有 只是非常少．．．
: : d.BER
: BER"通常"(major pathway)只會切掉一個"base"(所以才叫 Base Excision Repair)
: 但是BER有一個minor pathway 會把一小段的nucleotides flip out
: 關鍵就在這個minor pathway
: 因為在major pathway中, T-T dimer 是不可能被去掉的
: (只處理一個base, T-T dimer 已經牽涉到兩個base, 而且沒有適合的酵素)
: 所以就要看在minor pathway中, 有沒有可能把T-T dimer一次翻掉
: 不過我覺得這樣的解釋很牽強, 有點像知道答案以後硬湊的說法
: 而且一般教科書也不會提到 minor pathway
: 所以如果是複選 D 我也會選, 但是單選的話就只挑E
講minor很奇怪，至少很多人是以indirect/direct SSBR來稱呼你所謂的ma/mi BER
上述的說法有可能，但是難以找到明確的機制
另一種可能的解釋是現今已發現一種Pyrimidine Dimer Glycosylase
PDG可以辨識UV-induced CPD，並且透過下游APE1(也就是經過BER路徑)完成修復
對了，Trevigen就有賣這個酵素
: : e.Alkytransferase
: 這個一定不行 T-T dimer 跟 Alkylation 沒有關係
: : e : 我不確定甲基化傷害是否會造成 crosslink 然後被Alkytransferase修復
: 不會
: : 剛剛辜狗了一下
: : e 選項的酵素可以帶入
: : O6MG methyltransferase
: : 而O6MG屬於DNA lesion的一種 (雖然不知道為什麼)
: 因為G的O6 position 被methylated了, 就少了一個可以形成H-bond的位置
: 通常G是以3個H-bond pairs to C
: 如果O6metG沒被修復的話, 在經過replication後
: O6metG就會變成跟T配對(原來是C)
: 然後再經過一次replication 這個T又跟A配 這樣兩股DNA的sequence就全變了
: 簡單說(H-bonds我都用-簡化):
: G-C ----> O6metG-C ------------> O6metG-T -------------> A-T
: 正常 replication replication
: (這裡說明得很糟, 希望看得懂)
: O6metG methyltransferase的作用, 就是去除O6上的methyl group
: ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
: ｏｋ 看的懂
很清楚
一般來說G:C比G:T的效率與穩定度大概是10^n：1，n至少大於三
但O6-meG:C與O6-meG:T為近乎一致的1：1，因此pol放錯機率大增
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推
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