[程式] 使用R cluster 處理microarray資料

看板BioMedInfo作者 (左慈)時間15年前 (2009/02/12 06:44), 編輯推噓2(2推 0噓 5→)
留言7則, 3人參與, 最新討論串1/4 (看更多)
想問大家一個問題， 我的狀況是資料比數太大， 使用hclust，將資料as.dendrogram，再str看結果， 可是資料太大即使捲軸在最高， 分群結果還是無法從頭開始。 plot更慘，完全擠在一起，根本看不出結果。 圖片 http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/756.page 想問版友： 1. 有沒有指令可以將分群結果輸出成 .txt ？ 2. 或者其他分群package有包含可將分群結果輸出的指令？ 重點就是 我該如何得到分群結果。 先謝謝大家，等待好消息 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 149.171.224.229
推
02/12 16:52, , 1F
你要不要用cluster 3.0搭配Java TreeView來做
02/12 16:52, 1F
→
02/12 16:52, , 2F
或是用GAP等clustering的軟體來做
02/12 16:52, 2F
→
02/12 16:55, , 3F
至少這些工具visulization的部分比較好
02/12 16:55, 3F
推
02/13 10:43, , 4F
樓上提到的 有整合在MeV裡 個人覺得還不錯用
02/13 10:43, 4F
→
02/13 17:02, , 5F
謝謝 我試試cluster3.0 什麼是MeV
02/13 17:02, 5F
→
02/13 18:51, , 6F
google key word: MeV <--第一筆就是了
02/13 18:51, 6F
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02/17 15:04, , 7F
MeV太讚 真是好用 謝謝樓上所有人
02/17 15:04, 7F
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