[程式] Hierarchical Clustering
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[軟體程式類別]:
R
[程式問題]:
Hierarchical Clustering
[軟體熟悉度]:
高(1年以上)
[問題敘述]:
小弟目前用大腸直腸癌病人甲基化的資料做 clustering。
我老闆希望圖長得像這樣：http://ppt.cc/XO7p
圖的出處是
"DNA methylation profiling reveals novel biomarkers and important roles for
DNA methyltransferases in prostate cancer"
published on Genome Research
x軸是癌症/正常細胞，y軸是不同位點甲基化資料，對x軸做cluster，
頂端那些dendrogram要依照癌症/正常細胞分成藍色跟紅色，
試了幾個R常用的package都沒有發現類似的功能。
其實我也蠻好奇，當兩個細胞要合併成一組的時候，
如果一個是紅色，一個是藍色，那合在一起之後應該用那種顏色？
想請問版友有沒有畫過類似的圖，或是看過類似的paper。
如果有煩請告知小弟，不勝感激。
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