[討論] LC-MS 的多變量分析
想請教的問題：這篇 paper 後面有畫 3D-PCA Score Plot
請問這篇 Paper 用來做 PCA 的變數是？
Metabonomic Study of Aristolochic Acid-Induced Nephrotoxicity in Rats
http://pubs.acs.org/cgi-bin/abstract.cgi/jprobs/2006/5/i04/abs/pr050404w.html
這一篇的 introduction 翻譯：
代謝體學是現今在研究生物體運作機轉的新興方法。
它可以被應用於研究不同生理環境(例如是否感染某疾病或食用某種物質)的條件下，
檢視個體的代謝產物群其成分的相對含量，
並藉由其成分的相對含量推論在該生理環境下，代謝機制的改變情況。
在此類研究中常用的工具包含電噴霧離子分光儀併用液體分光儀(HPLC-ESI-MS)，
在某些研究中還會加上其他分析儀器，
例如核磁共振(NMR)和氣相管柱層析併用質譜儀(GC-MS)。因著這些儀器的解析度、
敏感性和可重複使用性，都成為代謝體學這樣的研究模式下常會用到的工具。
此外，在這樣的研究模式下，某些統計技術也成為在標定疾病的生物標定物時的方法，
這些技術包含主成分分析(PCA)、部分最小平方法(partial least square)、
類神經網絡(artificial neural network)和ANOVA-同步成分分析(ASCA)。
在本篇研究中，研究者主要是探討由馬兜鈴酸(Aristolochic acis, AA)
引發腎中毒的個體，其代謝產物中成分相對含量的情況。
過去曾有回報出個案在食用含馬兜鈴酸的植物後產生急性腎衰竭的情況，
也有個案在使用別的含此物質的植物後出現末期腎臟疾患的症狀。然而，
即便馬兜鈴酸和腎藏機能有所關聯，但其病理機制卻仍不清楚。
研究者基於此點，在這篇研究中，利用現今在代謝體學上常用的技術
液體管柱層析併用質譜儀(LC-MS)分析法，並併用一些圖形辨認技術，
研究大鼠(Rat)在中毒初期、中毒過程和腎病復原過程的尿液代謝物，
並加以利用一些統計技術的分析，包含利用PCA區分健康老鼠和中毒老鼠、
利用線性區辨分析(LDA)來分析尿液代謝物間的相對含量大小等。
期望藉由代謝體學研究的模式，在儀器和統計技術的搭配下，
可以對馬兜鈴酸損傷腎臟機能的病理機制有更深的了解。
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