[公告] 生物實驗 小量質體DNA製備 講義更新
小量質體DNA製備
目的:利用細菌的生理特性及藥物之處理,將E. coli 的菌體分解或打破,以分離及純化
出質體(plasmid) DNA。
原理:
此實驗為利用小量質體純化試劑組來抽取大腸桿菌質體DNA 之快速方法,以改良過的
鹼溶裂法打破細胞,並配合所選的吸附膜純化管組,從細菌中萃取質體DNA。
利用含SDS的鹼性溶液處理細胞。SDS可將細胞膜打破,而鹼會破壞DNA的氫鍵,導致
DNA變性(由雙股變為單股狀態),再加入酸性溶液中和後,使單股回復為雙股DNA。在急速
中和反應中,染色體DNA因分子龐大鹼基匆忙配對形成一雜亂無序的巨大分子,對水的相
對溶解度低。相反的,質體DNA因分子小,兩單股恢復鹼基配對快而易溶於水中 ,故只要
經過離心,即可將染色體DNA與質體DNA分離。
再利用silica membrane的column來萃取上清液。因核酸在高鹽下質體DNA能與
silica membrane吸附在一起,而蛋白質、多醣類或脂質則無法吸附。利用含有酒精的
Wash buffer清洗silica,將殘留蛋白質、多醣類或脂質清洗。最後以低鹽溶液(水或TE
buffer)將核酸從silica 上清洗下來。
實驗器材:
含有質體的大腸桿菌E.coli (pCDH)
High-Speed plasmid mini kit
離心管
離心機
電泳裝置
實驗步驟:
1. 將培養好的菌液取1 .5ml於離心管中,以14000xg離心1分鐘,使液態培養基中的菌體
集中於管底,離心完後去除上清液。
2. 加入200μl的PD1 Buffer,以震盪器將沉澱的菌體打散至均勻混合。
3. 加入200μl的PD2 Buffer ,輕輕的上下反轉tube(約10次左右),置於室溫3分鐘。
4. 加入300μl的PD3 Buffer ,輕輕的上下反轉tube(約10次左右),以14000xg離心3分鐘
。
5. 將column插入collection tube中,將步驟4離心後的上清液倒入column,再以
14000xg離心1分鐘。
6. 將濾液移除後,再把column插回collection tube後加入400μL W1 Buffer於column
,之後以14000xg離心1分鐘。
7. 將濾液移除後,再把column插回collection tube後加入600μL Wash Buffer並以
14000xg離心1分鐘。
8. 將濾液再次除去後,再把column插回collection tube後以14000xg離心3分鐘。
9. 移除collection tube將column置於另一個新的離心管中,之後加入50μL的Elution
Buffer至column中靜置2分鐘後,以14000xg離心2分鐘。
10. 取DNA溶液跑電泳。
問題與討論:
1.請說明此實驗分離plasmid的方法如何將chromosomal DNA去除而保留plasmid DNA?
2.為何solution II加入後僅能將管子上下反轉而不可劇烈震盪呢?
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結報別寫錯囉~
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