[心得] 胡毓志生醫資料探勘

看板NCTU-Teacher作者arokaHTC (阿口力)時間4年前 (2019/05/30 16:03)推噓4(4推 0噓 1→)

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⊕課名⊕ 資科工所 4IJK 生醫資料探勘 ▲教授▲ 胡毓志 ★修課年度★ 107-1 ￡教了什麼￡（課程大概內容。或是額外學會了什麼東西。） 1. Introduction to Data mining 2. 很基礎的分子生物學 (DNA --轉錄-> RNA --轉譯-> 蛋白質) 3. Motif Finding (一級結構) 4. Advanced Motif Finding (二級結構) 5. Decision tree 6. Microarray 7. Evaluation 8. Unbalanced Data 9. Ensemble Learning & Meta Learning 10. 實例：止痛針劑量的 data mining 詳見：https://hackmd.io/s/rymylOppE ◆上課方式◆（投影片、團體討論、老師教學風格）上課用自製投影片，但現在不知道還會不會公開到 e3 上。老師口條算清楚，蠻多東西會講得很簡單，偶爾用版書。 ▼考試作業▼ 以前的心得文說會投票決定要不要考試，但每年結果都是不考，所以今年就不投票了(?) 25% Quiz (共三次隨機小考) 40% Presentation 12% 教授評分 12% 助教評分 16% 同學評分 35% Report 17.5% 教授評分 17.5% 助教評分期末每次提問加總分 0.5 ---小考--- 不會事先提前告知小考，因為希望大家來上課，老師說如果他前一天心情不好可能就會考。小考大概就三題左右，差不多上次上課內容，比如說第一次考寫出分子生物學中心法則、DNA 鹼基有哪四種...(ATCG) 第三次考選擇題，用 t-test 做假設檢定，哪幾個機率分佈是合理的(不用算東西)。 ---期末 presentation-- 選定一篇和生醫資料探勘有關的 paper 來報告，present 10 分鐘 + Q&A 5 分鐘。也有人挑完全沒生醫成份的 paper，挑完後寄信給教授，教授回覆沒問題就可以。原則上報難度越高的 paper 分數會越高，有一些人有生物背景或在做生資的實驗室，就挑了生醫成分很高的 paper。在報告前一週要把 paper 和投影片上傳，助教會公開當週要報告的投影片，方便大家提早看。 Present 的分數共 40% 由老師、助教、每一個同學打分數，同學也要聽每個人的報告並寫評論打分數。評論同學的內容會再由老師助教打一個分數共 35%，詳細的配分寫在上面了。期末報告會有開放提問，每次提問會加總成績。￥其他￥（是否注重出席率or嚴禁遲到？需要的基礎？）要注意一下小考其實有點重，今年的算法一次就佔總成績 8 分沒考到小考的要在期末多問點問題補回來。去年修課 37 個人，可能平均一週 10 個人報太多了，今年好像有把修課上限人數調降。￠最後想說的話￠這門課難度很低、上課很涼，基本上沒有什麼門檻適合完全不熟資料探勘的人，或是沒報過 paper 想練習一下讀 paper 的人。但上完這門課也只知道一些生醫資料探勘的傳統方法、傳統問題，不會學到太多資料探勘的東西。分數有一部分來自其他同學評自己的 present，但是有些人根本就沒認真在聽...評論直接空白這部分覺得有點微妙。大部分的人分數落在 80 幾，平均 78，好像被當的就沒調分了。補上成績分布供參考： https://i.imgur.com/dC8eVYS.png

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qwe19272375

06/04 11:49, 4年前 , 1^F

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asd2260123

06/06 16:47, 4年前 , 2^F

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moonoftree

06/10 15:47, 4年前 , 3^F

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