有關分子動態模擬
分子動態模擬 (molecular dynamics simulation )
insightII 內建的 force field
沒有我compound能用的
我們實驗室不是專門領域, 但老師給我這項工作
目前用的軟體是高速電腦中心裡的insightII(2005) 及 insightII400P+
我的compound是H2O, ZnSO4, 及一種叫xylenol orange
一開始在insightII 力場是用esff, 也是最符合我實驗的狀況
不過轉到insightII400P+上面的 Amorphous Cell上面要做mixture時
轉到cvff, 此時ok!
但到了refine , 又轉回去esff直到要將cell置入periodic boundary condition時
insightII400P+去出現 error message : 說Discover的版本太舊, esff無法使用
(insightII400P+裡本身也有內建esff, 但它卻說不能用 = =")
請問有那位好心人能提供我能用的力場??
力場內最主要的離子是Zn+2, 請問有人有嗎??
現在壓力好大, 我看了一堆paper, 但還沒找到答案= ="
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