[問題] r+hadoop中rmr/rhdfs問題

看板Linux作者 (rlearner)時間7年前 (2016/12/27 22:47), 編輯推噓0(007)
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[目的] 在VM上建立三台虛擬機 並建立rhadoop 執行簡單的rmr範例 [問題簡敘]============================================================= 在VM虛擬器上建立hadoop環境建三台機子, master,node1,node2 裝好了hadoop(hadoop可以運作) 但是裝R時遇到了無法library:rmr和rhdfs的問題 且無法install.packages:rJava套作 上敘的環境我裝了兩次 第一次(環境一)不知怎麼的就成功install.packges: rJava的套,但第二次重裝(環境二)卻怎麼樣也無法成功下載 rJava,若rJava無法,rmr跟rhdfs也用不了了!! [環境一]((提外話~之前莫明成功???)))===================================== 怎麼裝有點忘了,但跟第二次差不多 感覺還是有點問題...(下有影片連結) https://www.youtube.com/watch?v=ByAisA_dQxI&feature=youtu.be
[環境二](!!!!!主要問題!!!!!!現在安裝失敗)))============================= [安裝步驟] 以下是我安裝的方法:(文長)(含安裝步驟影片) https://www.youtube.com/watch?v=QTHfV_xYr8A&t=145s
沒剪輯7:04-14:30可跳過~下載很久@@ 啟動hadoop cd ~/hadoop && sbin/start-all.sh ------------------------------------------------ sudo vim .bashrc sudo vim /etc/environment sudo vim /etc/profile 在以上三個檔中新增路徑 export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/jdk/ export HADOOP_CMD=/home/hduser/hadoop/bin/hadoop export HADOOP_HOME=/home/hduser/hadoop export HADOOP_STREAMING=/home/hduser/hadoop/share/hadoop/tools/lib/hadoop-streaming-2.7.3.jar 重啟三個檔案 . /etc/environment . /etc/profile source .bashrc ----------------------------------------------------------------------------- 三個機子都要安裝R sudo apt-get update sudo apt-get upgrade sudo apt-get install r-base sudo apt-get install r-base r-base-dev java 設訂------------------ echo $JAVA_HOME sudo JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/jdk/ R CMD javareconf in the R-------------------- 進入R sudo R 這裡有錯誤,無法下載rJava(!!!!!問題所在)(註1) install.packages(c("codetools","R","Rcpp","RJSONIO","bitops","digest","functional","stringr","plyr","reshape2","rJava","caTools")) 下載rmr 和 rhdfs wget --no-check-certificate https://raw.github.com/RevolutionAnalytics/rmr2/3.3.0/build/rmr2_3.3.0.tar.gz wget --no-check-certificate https://raw.github.com/RevolutionAnalytics/rhdfs/master/build/rhdfs_1.0.8.tar.gz 在R中---------------------- 第二次安裝出錯 (註2) install.packages("/home/hduser/rhdfs_1.0.8.tar.gz", repos=NULL, type="source") install.packages("/home/hduser/rmr2_2.2.2.tar.gz", repos = NULL, type="source") Sys.setenv(HADOOP_HOME="/home/hduser/hadoop") Sys.setenv(HADOOP_PREFIX="/home/hduser/hadoop") Sys.setenv(HADOOP_CMD="/home/hduser/hadoop/bin/hadoop") Sys.setenv(HADOOP_STREAMING="/home/hduser/hadoop/share/hadoop/tools/lib/hadoop-streaming-2.7.3.jar") Sys.getenv("HADOOP_CMD") 後面就不用看了...因為全不行@@ ------------------------------------ 無法下載rJava後,後面步驟都出錯了QQ [錯誤息訊]============================================================= (安裝環境二) https://www.youtube.com/watch?v=QTHfV_xYr8A&t=145s
7:04-14:30可跳過~下載很久@@ (註1)14:30 在install.packages(c("codetools","R","Rcpp","rJava"...後失敗,錯誤訊息: ...waring messages: 1: package 'R' is not available (for R version 3.2.3) 2: Ln install.packages(c(......) 'rJava' had non-zero exit status (註2)16:38 install.packages("/home/hduser/rhdfs_1.0.8.tar.gz", repos=NULL, type="source") install.packages("/home/hduser/rmr2_2.2.2.tar.gz", repos = NULL, type="source") 兩個都出現: would you like to use a personal library instead? 我只能選y 懷疑這裡也出了問題 因為RDM網站有提到library要設定給所有用戶(其實不太懂意思..@@) http://www.rdatamining.com/big-data/r-hadoop-setup-guide 在7.1 Install relevant R packages的地方 原文: RHadoop packages are dependent on above packages, which should be installed for all users, instead of in personal library. ....文長以下略 但我不知到在install.packages那些套件前 要怎麼給所有使用者用(這裡的意思應該是三台機子吧@@ [版本]============================================================= (三台機子都是) ubuntu 16.04.1 hadoop-2.7.3 R 3.2.3 rmr2 3.3.0 rhdfs 1.0.8 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.128.101.143 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Linux/M.1482850033.A.98F.html

12/29 03:36, , 1F
以前遇過類似的問題,忘了有沒有解決了
12/29 03:36, 1F

12/29 03:37, , 2F
不過後來發現apt-get install r-cran-rjava可以裝rJava
12/29 03:37, 2F

12/29 03:38, , 3F
後來就都用apt-get裝了,也許可以試試看?
12/29 03:38, 3F

12/29 03:48, , 4F
至於關於註2, 個人推測因為你第二次進R安裝時沒有sudo
12/29 03:48, 4F

12/29 03:55, , 5F
沒sudo, install.packages就變成只有你安裝的使用者能用
12/29 03:55, 5F

01/11 15:53, , 6F
感謝as大大
01/11 15:53, 6F

01/11 15:53, , 7F
rJava的問題解了
01/11 15:53, 7F
文章代碼(AID): #1OOdxncF (Linux)