[爆卦] 英美研究2019-nCov到二月初的傳播預測

看板Gossiping作者 (tango)時間4年前 (2020/01/25 00:40), 4年前編輯推噓124(133推 9噓 72→)
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從港仔的連登討論區看到的小弟我跟流病不熟，只能幫忙翻譯，還望高手解說。 【大檸樂】初步研究指出武漢肺炎基本傳染數(R0)高過殺咗5千萬人嘅西班牙流感 - 分享自 LIHKG 討論區 https://lih.kg/eNmMLS s Google pdf連結如下 https://bit.ly/2vllEbp 重點 Key findings ● We estimate the basic reproductive number of the infection ( 0) to be significantly greater than one. We estimate it to be between 3.6 and 4.0, indicating that 72-75% of transmissions must be prevented by control measures for infections to stop increasing. 傳染很猛的意思。 ● We estimate that only 5.1% (95%CI, 4.8–5.5) of infections in Wuhan are identified, indicating a large number of infections in the community, and also reflecting the difficulty in detecting cases of this new disease. Surveillance for this novel pathogen has been launched very quickly by public health authorities in China, allowing for rapid assessment of the speed of increase of cases in Wuhan and other areas. 目前的公開數字大概只有預估感染者的5% ● If no change in control or transmission happens, then we expect further outbreaks to occur in other Chinese cities, and that infections will continue to be exported to international destinations at an increasing rate. In 14 days’ time (4 February 2020), our model predicts the number of infected people in Wuhan to be greater than 250 thousand (prediction interval, 164,602 to 351,396). We predict the cities with the largest outbreaks elsewhere in China to be Shanghai, Beijing, Guangzhou, Chongqing and Chengdu. We also predict that by 4 Feb 2020, the countries or special administrative regions at greatest risk of importing infections through air travel are Thailand, Japan, Taiwan, Hong Kong, and South Korea. 如果防疫還是這個鳥樣子，到二月初武漢會有25萬人感染，北上廣深圳通通爆發，附送泰國日韓港台灣。 ● Our model suggests that travel restrictions from and to Wuhan city are unlikely to be effective in halting transmission across China; with a 99% effective reduction in travel, the size of the epidemic outside of Wuhan may only be reduced by 24.9% on 4 February. 封城無用，只要有1%的人從武漢離開，到二月初也只能降低武漢外約25%的感染數。 ● There are important caveats to the reliability of our model predictions, based on the assumptions underpinning the model as well as the data used to fit the model. These should be considered when interpreting our findings. 以上是模型預測的，不準不要怪我。 ********分隔線******** 畢業後好久沒有熬夜看peper，聲明如下： 1.小弟念的跟公衛沒關係，微積分也有修沒過。單純好奇研究方法加上剛好年假。 有興趣往下看的大大們姑且當作看別人的閱讀筆記，我也有附上也有找wiki找定 義的出處。好處是如果知道這研究怎麼出來的比較不會被嚇到，如果沒興趣的不要 罵我。歡迎專家高手學長姐指正。 2.作者也強調他的研究限制，包含現在算爆發早期很多假設還不是很確定，然後交通 資料庫沒有考慮公路鐵路、封城的控制手法、隨機效應...。不過假設也只能給他假 設，香港人都說海鮮市場被清理過了找不到源頭，死無對證。 3.快睡著了，後面的討論看得很費力。等我醒來再來慢慢補 ********分隔線******** 先看作者 第一作者： Jonathan M. Read https://bit.ly/2TUvjjf 被引用最多的一篇200多次，2008年。看來他做感染散佈做很久了。 Dynamic social networks and the implications for the spread of infectious disease JM Read, KTD Eames, WJ Edmunds Journal of The Royal SocietyInterface 5 (26), 1001-1007 這期刊在2018年IF還有3.224。 通訊作者： Chris Jewell https://bit.ly/30Xh0Mr 被引用最多的一篇307次，2011年。 Networks and the epidemiology of infectious disease L Danon, AP Ford, T House, CP Jewell, MJ Keeling, GO Roberts, JV Ross, ... Interdisciplinary perspectives on infectious diseases 2011 大概是這個研究提供運算模型的。 來看內文吧。 *背景與疫情現況 2019/12/31中國官方通知WHO有疫情。 2020/1/7 定序完成 源頭未知只知道跟海鮮市場有關係 2020/1/21 WHO表示可能人傳人 2020/1/22 確診600病例，其中444人在湖北。 後續報告出有旅行史病患。 目前報告出的症狀有發熱、咳嗽、呼吸急促。重症有包含肺炎、嚴重的呼吸道症候群、腎衰竭。 武漢當地報告17死亡，主要是老人與或是慢性疾病患者。 目前的資料還不足以了解全貌。但是隨著春運增加會顯著增加病原散播。 *武漢的國內外交通狀況 市區居民一千一百萬，有高鐵與機場。2017年一月有67萬人從武漢出發，主要是去上海5.3? *Transmission model 傳染模型 在google上找到SEIR metapopulation model是微分方程組，由具有連續時間的離散空間模? 出處https://bit.ly/37r69N8 作者用這個模型應該加上前面的資料庫來貼近目前已經在中國主要城市還有其他國外國家的 這個模型要以2020/1/21的病患數量為準。 *Epidemiological parameter estimates 傳染病學參數估計 有關transmission rate的wiki，只有英文 https://bit.ly/2RpSMrd 這個假設是一個感染病要傳播需要 1.感染者 2.容易被感染的人 3.這兩者的單位時間內的有效接觸率β= 總接觸率γ*感染風險p. 作者估計傳輸率1.07，另外發現infectious period=3.6天 (上一段有提到infectious period= 1/recovery rate，應該譯做感染期？) 感謝老天基本感染數R0 reproduction number有中文wiki https://bit.ly/2RO8zyP 假設染病的個體在單位時間內產生出β個接觸，進而造成的新感染有著其感染期間為1/γ，所以計算基本感染數為R0=有效接觸率β/總接觸率γ 計算得R0=3.8 (95%CI, 3.6–4.0), (3.6*1.07=3.852?) 結論：這東西感染力至少不遜於SARS。 *感染預報 用上面的模型他們預報透過飛航旅行造成的疾病散播狀態。這個研究有很高的假設性：沒有任何控制干預，傳染中參數不會變，旅行者的行為到其他國 家也跟假設一樣，陸運鐵運不考慮。作者估計從2020/1/21在武漢有3493人感染，而從今年一開始被感染過（應該包含康復的？）有11341人。另外也假設115個感染者在中國其他地方。估計從1/1~1/18有4764人，類似其他研究的數據。 作者的模型顯示到2/4以前的兩週內疫情持續加溫，到2/4那天有191529人新染病，總數達250370人。在上海北京廣州重慶成都會有新爆發，然後在泰國 會有相當高輸入風險 、接下來依序是日本、台灣、香港、南韓、美國、大馬、新加坡、澳洲、越南。 (這邊內文沒有提到怎麼算輸入風險，大概是他們模型內演算出來的。) *進出武漢的旅遊限制之效力 從1/23中國官方開始封城，作者在他們的模型裡面調整外逃的市民比例從 50%~99%，只會分別降低原來預期的12.6%~24.9%。跟其他研究的結果一樣 ，封城只會延緩疾病到達其他地區，而不是整體壓制散佈。然後又再強調 了一次他們只有針對空運做分析，陸運沒考慮。 跟SARS與MERS比較可傳遞性 這邊算的rereproductive number比其他SARS還有MERS都來得高，但是跟 其他SARS早期的研究差不多。SARS的R0是1.1~4.2，多數研究集中在2~3，隨方法而異。MERS的R0就相當低，少於1，大約是在0.5，但是會隨著衛生相關的設定而異。 *Doubling time倍增時間 SARS的倍增時間是4.6天到14.2天。作者發現，2019-nCov的倍增時間是4.1天，但是用1/1與1/21的人數，分別是24人與11257人，他們也算到另外一個數據是2.3，這個跟SARS之前在香港爆發時候的研究類似。 *Liminations研究限制 包含許多數字上的假設，只有航空公司的數據，旅遊限制的模型沒有考慮隨機效應可能造成低估。不考慮控制方面的動態變化或其他因素，也不考慮監視與報告。……Z_z 心得： 我等台灣人看了幾天笑話，幸災了幾天樂禍.... 小七店員有幾個戴口罩的？ 捷運手扶梯的扶手有沒有固定拿表白水嚕乾淨？ 電梯按鈕有幾個上面有透明塑膠片遮著還得清潔？ 百貨公司門口可以掛酒精小噴瓶的地方掛了沒？ ....... 無重大八卦請勿使用此分類，否則視同濫用爆卦鬧板(文章退回、水桶6個月) 未滿30繁體中文字 水桶3個月 ----- Sent from JPTT on my iPhone -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 115.82.181.11 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Gossiping/M.1579884050.A.763.html
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01/25 00:41, 4年前 , 1F
快逃阿
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推
01/25 00:42, 4年前 , 2F
慟！
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推
01/25 00:42, 4年前 , 3F
怕
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推
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靠 台灣海關加油阿...
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推
01/25 00:42, 4年前 , 5F
台商們會繼續吸奶嗎
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推
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看看那篇的figure 3 日本QQ
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推
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生化武器
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推
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隔壁低能國就是慘
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01/25 00:42, 4年前 , 9F
WHO 等沒在怕了
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推
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幹 可以關閉邊境嗎 禁止中國人來了
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推
01/25 00:43, 4年前 , 11F
這傳染性比sars強
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01/25 00:43, 4年前 , 12F
台灣要撐住啊…
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01/25 00:43, 4年前 , 13F
趕快轉給疾管署
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有同學在tFDA，不過不知道是不是他的業務。
噓
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請政府即刻停止中國航線
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推
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這預測真的有點誇張 但也不無可能
01/25 00:43, 15F
多少還是有點根據，它誇大了最好，就怕它低估。
推
01/25 00:44, 4年前 , 16F
這個翻譯很可以啊
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推
01/25 00:44, 4年前 , 17F
超過25萬人喔
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01/25 00:44, 4年前 , 18F
還封什麼武漢旅遊團 快點把全中共都斷航
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01/25 00:44, 4年前 , 19F
01/25 00:44, 19F
推
01/25 00:44, 4年前 , 20F
能關閉中國入台了嗎 怕爆
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推
01/25 00:44, 4年前 , 21F
一人可以傳四人
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推
01/25 00:44, 4年前 , 22F
who還在裝死 操 台灣要上緊發條了
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推
01/25 00:44, 4年前 , 23F
東北亞+東亞+東南亞 一起GG囉
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推
01/25 00:45, 4年前 , 24F
請蔡英文直接封閉對中航線，我不想
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01/25 00:45, 4年前 , 25F
賭！！！
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推
01/25 00:45, 4年前 , 26F
不是說30萬人逃離武漢，大概3%...往東最
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推
01/25 00:45, 4年前 , 27F
我們就算真的全面斷航，台灣還有金
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01/25 00:45, 4年前 , 28F
門這個問題
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推
01/25 00:45, 4年前 , 29F
傳播幸福分享愛
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推
01/25 00:45, 4年前 , 30F
台灣一定守不住的，年後台商開始返回
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推
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幹 相比對象竟然是西班牙流感 怕爆
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推
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幹 這看了胃痛
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01/25 00:45, 4年前 , 33F
崗位出差，台灣差不多就準備等著爆發
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推
01/25 00:45, 4年前 , 34F
WHO是怕派人去 像去自殺嗎...
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了。
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推
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不意外,都在上升期了,會大量增加中槍人數...
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推
01/25 00:46, 4年前 , 37F
超級Sara,死亡率低一點換來高傳染性
01/25 00:46, 37F
還有 141 則推文
還有 3 段內文
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01/25 02:10, 4年前 , 179F
柯粉：模型預測算啥，我們只信高素質的中
01/25 02:10, 179F
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01/25 02:10, 4年前 , 180F
國官員
01/25 02:10, 180F
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01/25 02:20, 4年前 , 181F
台灣海關的各位大大 要辛苦你們了
01/25 02:20, 181F
推
01/25 02:21, 4年前 , 182F
還在扯柯的真的是沒救了
01/25 02:21, 182F
推
01/25 02:26, 4年前 , 183F
高調
01/25 02:26, 183F
推
01/25 02:44, 4年前 , 184F
大家快逃啊，去英格蘭或冰島才能活下來
01/25 02:44, 184F
推
01/25 03:06, 4年前 , 185F
日本夏天還有奧運會要辦……
01/25 03:06, 185F
對啊，那為什麼是泰國的進口風險最高？奇怪，database偏誤嗎？
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01/25 03:11, 4年前 , 186F
幹
01/25 03:11, 186F
推
01/25 03:17, 4年前 , 187F
幹
01/25 03:17, 187F
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01/25 03:33, 4年前 , 188F
有這種鄰居真的衰小
01/25 03:33, 188F
推
01/25 03:47, 4年前 , 189F
哇勒
01/25 03:47, 189F
推
01/25 03:53, 4年前 , 190F
幹真的瘟疫公司
01/25 03:53, 190F
推
01/25 04:17, 4年前 , 191F
真的覺得會比SARS還嚴重，台灣很慘
01/25 04:17, 191F
推
01/25 04:25, 4年前 , 192F
WHO 能不能解散然後發言人和總幹事按照重
01/25 04:25, 192F
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01/25 04:25, 4年前 , 193F
大公共危險罪上國際法庭？？？？
01/25 04:25, 193F
推
01/25 04:32, 4年前 , 194F
怕爆
01/25 04:32, 194F
※ 編輯: purineboy (115.82.181.11 臺灣), 01/25/2020 05:47:03
推
01/25 05:05, 4年前 , 195F
幹
01/25 05:05, 195F
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01/25 05:05, 4年前 , 196F
全面斷航啊
01/25 05:05, 196F
※ 編輯: purineboy (115.82.181.11 臺灣), 01/25/2020 05:58:35
推
01/25 06:44, 4年前 , 197F
中國來的原機遣返，不準落地
01/25 06:44, 197F
噓
01/25 06:54, 4年前 , 198F
翻譯短又爛到快要變成超譯
01/25 06:54, 198F
推
01/25 07:23, 4年前 , 199F
中共要垮台了
01/25 07:23, 199F
推
01/25 07:31, 4年前 , 200F
推
01/25 07:31, 200F
推
01/25 07:32, 4年前 , 201F
塊陶啊
01/25 07:32, 201F
推
01/25 07:55, 4年前 , 202F
可是我家小七店員都有戴口罩了
01/25 07:55, 202F
※ 編輯: purineboy (101.12.180.32 臺灣), 01/25/2020 08:13:34
噓
01/25 08:41, 4年前 , 203F
高估支那狗的智商了吧
01/25 08:41, 203F
推
01/25 08:46, 4年前 , 204F
推
01/25 08:46, 204F
推
01/25 09:23, 4年前 , 205F
光看武漢這地理位置就不妙了…
01/25 09:23, 205F
推
01/25 09:54, 4年前 , 206F
真的是12隻猴子
01/25 09:54, 206F
推
01/25 11:04, 4年前 , 207F
這真的是要針對全中國斷航了，包含轉機
01/25 11:04, 207F
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01/25 11:04, 4年前 , 208F
的也全部限制入境。
01/25 11:04, 208F
推
01/25 11:45, 4年前 , 209F
推推
01/25 11:45, 209F
推
01/25 11:46, 4年前 , 210F
坐火車蠻多人有戴口罩了
01/25 11:46, 210F
推
01/25 11:50, 4年前 , 211F
推
01/25 11:50, 211F
推
01/25 11:56, 4年前 , 212F
怕
01/25 11:56, 212F
推
01/25 12:37, 4年前 , 213F
請政府下令公共場所得員工一律配戴口罩
01/25 12:37, 213F
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01/25 12:38, 4年前 , 214F
公共場所一律門口懸掛酒精。
01/25 12:38, 214F
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