[討論] 遺傳流病報告

看板Epi-96作者 (超級無敵阿白)時間18年前 (2007/12/25 15:39), 編輯推噓5(504)
留言9則, 4人參與, 最新討論串1/1
親愛的同學 我們第一週先來報linkage analysis的結果 因為association data有比較多可以玩我們晚點再報 那第一週的部份我們大概有以下內容 1. (依給的精神分裂症/CPT(找出切點分兩群) non-parametric linnkage parametric linkage 2.連續的CPT或/adjusted CPT QTL (用Merlin跑) 3. 針對candidate region結果去review 有哪些gene或者研究已經被報告過的 4. 挑出特定的人跑TDT還是別的(給對研究有熱情的人玩的) 譬如挑affected sibpair, 或triads data 再玩family-based association study 5. (時間很多又沒事做的人可以做看看) 以CPT當endophenotype分析精神分裂 也就是genetic marker--->CPT--->精神分裂 這部份就去想有什麼不一樣的分析方法 PS.那些是Microsatellite markers (STR, short tendem repeat) 一個數字就代表一種allele 譬如說我是122 130 就是我的polymorphism是repeat 122及130這兩種allele 然後要不要刪missing還是用哪些family members做都是給你們自己選 加油喔 新年快樂 -- -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.4.235

12/25 18:16, , 1F
原PO是雅堂助教 有問題就問他吧
12/25 18:16, 1F

12/25 19:25, , 2F
問題!請問*.in檔案裡面的marker位置怎麼寫?
12/25 19:25, 2F

12/25 20:06, , 3F
聽說~marker=0就是missing~所以要刪掉(?) 這樣刪好多XD
12/25 20:06, 3F

12/25 21:16, , 4F
什麼*.in呀,裡面有需要寫marker位置嗎?
12/25 21:16, 4F

12/25 21:21, , 5F
 ̄ ̄是指*.dat嗎?
12/25 21:21, 5F

12/27 09:02, , 6F
就是要跑genen hunter的Command file啊啊不會寫>"<
12/27 09:02, 6F

12/27 21:04, , 7F
還是不要用genehunter吧!這個project重點在CPT
12/27 21:04, 7F

12/27 21:05, , 8F
精神分裂症的outcome是每組都一樣!
12/27 21:05, 8F

12/29 11:26, , 9F
握握吼~~~
12/29 11:26, 9F
文章代碼(AID): #17SBE_x8 (Epi-96)