[學習] gaussian計算問題

看板Chemistry作者 (nunuaan)時間6年前 (2018/05/29 20:20), 編輯推噓6(6030)
留言36則, 5人參與, 6年前最新討論串1/1
近期接觸這一套軟體 但接觸時間不長所以有些地方還不太了解 希望有熟悉這套軟體的人幫忙解惑 我在做二氧化矽的晶格結構 大略是排出來了 但計算到最後總是會出現L502 按過clean優化但會讓整個結構會扭曲變形 不知道設定上是不是有問題 另外我被交代算出光譜和剛性係數 光譜我大概還有點概念 但剛性係數查不太到相關資料 不知道有沒有熟悉的人能夠告知一下 感謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 218.161.83.103 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Chemistry/M.1527596428.A.6C7.html

05/30 16:31, 6年前 , 1F
你是使用什麼Method跟Basis-set ?
05/30 16:31, 1F

05/30 19:05, 6年前 , 2F
我是用DFT 3-21G 因為不是很熟所以其實大多地方都沒動
05/30 19:05, 2F

05/30 19:05, 6年前 , 3F
另外我沒用過水球所以不太了解怎麼用 很抱歉...
05/30 19:05, 3F

05/30 21:00, 6年前 , 4F
DFT是指B3LYP嗎?
05/30 21:00, 4F

05/30 21:00, 6年前 , 5F
是的
05/30 21:00, 5F

05/30 21:01, 6年前 , 6F
你可以先試試看半經驗方法的AM1、PM3、PM6
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05/30 21:02, 6年前 , 7F
搭配你之前用的3-21G進行opt計算
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05/30 21:05, 6年前 , 8F
L502通常是指SCF自洽場沒辦法收斂
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05/30 21:05, 6年前 , 9F
好的 我試試看 感謝
05/30 21:05, 9F

05/30 21:07, 6年前 , 10F
如果你會看關鍵字的話 或許可以找一下SCF Done那一欄
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05/30 21:08, 6年前 , 11F
看一下Convg = D是否快接近-8
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05/30 21:09, 6年前 , 12F
如果是-6 -7的話 可以試著輸入SCF=(MaxCycle=N)
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05/30 21:09, 6年前 , 13F
我記得預設的N=64 所以你可以嘗試輸入100以上
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05/30 21:10, 6年前 , 14F
或許就有可能成功。
05/30 21:10, 14F

05/30 21:15, 6年前 , 15F
這個還真的沒有接觸到 等等會注意的 感謝!
05/30 21:15, 15F

05/30 21:17, 6年前 , 16F
話說原PO是要算什麼的光譜?
05/30 21:17, 16F

05/30 21:31, 6年前 , 17F
其實只交代說去跑出二氧化矽(石英)的光譜跟剛性係數來討
05/30 21:31, 17F

05/30 21:32, 6年前 , 18F
論 我也不是很確定他明確指哪個 因為非本科系所以使用上
05/30 21:32, 18F

05/30 21:32, 6年前 , 19F
其實算是有點障礙...
05/30 21:32, 19F

05/30 21:34, 6年前 , 20F
阿....就我的直覺剛性係數好像是用查的?
05/30 21:34, 20F

05/30 21:36, 6年前 , 21F
至於光譜的話我覺得問清楚比較保險
05/30 21:36, 21F

05/30 21:37, 6年前 , 22F
我當初也是這麼說 但就被說不 要用算的所以有點混亂...
05/30 21:37, 22F

05/30 21:37, 6年前 , 23F
好的 總之我先試著讓它能夠收斂 感謝
05/30 21:37, 23F

05/31 00:28, 6年前 , 24F
貼個input吧
05/31 00:28, 24F

05/31 00:53, 6年前 , 25F
05/31 00:53, 25F

05/31 09:59, 6年前 , 26F
原來不是真的infinite system
05/31 09:59, 26F

05/31 16:12, 6年前 , 27F
算這種系統不該用Gaussian, 真要用請先去了解一下
05/31 16:12, 27F

05/31 16:13, 6年前 , 28F
periodic boundary conditions (PBC) 如何在gaussian上
05/31 16:13, 28F

05/31 16:13, 6年前 , 29F
使用, 相關資訊網路上應該都不難查到
05/31 16:13, 29F

05/31 16:19, 6年前 , 30F
拿分子團簇去模擬infinite system的晶格,起始點就錯了
05/31 16:19, 30F

05/31 16:19, 6年前 , 31F
即使真讓你收斂,算出來的東西也是亂七八糟
05/31 16:19, 31F

05/31 16:25, 6年前 , 32F
這樣的系統建議還是去找找專門計算solid state的軟體
05/31 16:25, 32F

05/31 16:27, 6年前 , 33F
像是VASP,CASTEP...以plane wave為基礎開發的計算軟體
05/31 16:27, 33F

05/31 17:03, 6年前 , 34F
我算出來真的是亂七八糟的XDDDD
05/31 17:03, 34F

06/01 00:37, 6年前 , 35F
了解 我試著查察查BC的使用也看看授權軟體中是否有上述
06/01 00:37, 35F

06/01 00:37, 6年前 , 36F
軟體能提供使用 感謝解惑
06/01 00:37, 36F
文章代碼(AID): #1R3KMCR7 (Chemistry)