[資訊] 2013諾貝爾化學獎 頒給計算化學
恭喜 Martin Karplus(Harvard), Michael Levitt(Stanford) and Arieh Warshel(USC)
經過了15年 終於又輪回計算化學的領域了
1998年的化學獎頒給了Kohn 和Pople, 他們開創的基礎讓化學家們有好用的DFT
和Gaussian, 對於小分子的量子化學計算功不可沒(相信板友們很多都用過Gaussian
和B3LYP吧)
量子化學透過計算分子中電子的波函數 可以得知分子的特性
並觀察和預測化學反應如何進行
然而 以現在的電腦運算速度 模擬超過1000顆原子的系統對量子化學幾乎是不可能的任務
所以對於牽涉到蛋白質的生化反應 量子化學只能望之興嘆
這時候就是換multiscale model 出場了
multiscale 的意思 是 先使用量子化學 得到分子鍵長 鍵角 彈性常數等參數
再根據這些參數構建出一個簡化的分子 如同球被不同彈簧連接
接下來就可以使用分子動力學(molecular dynamics)來研究這些巨大分子如何反應
就好像玩憤怒鳥一樣 一開始設定起始條件 然後讓分子按照設定的位能面做運動
藉此可以知道這些複雜的分子如何改變構型及反應
在生物體內眾多反應的進行和信號的傳播 都牽涉到蛋白質分子結構的改變
如果可以預測蛋白質的結構 對於了解疾病的機理 或是藥物分子的設計 都有很大的幫助
大家如果之前有下載一個分散式運算軟體 用空閒的運算能力計算蛋白質摺疊的計畫
就和今年的化學獎是同一件事情
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三個得獎的人裡我聽過其中兩位的演講
Warshel戰力很強 我之前看到他在會議場合戰別人XD
我老闆對於multiscale的貢獻也不小 結果沒他的份 幫他哭哭 :~
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 131.215.220.166
※ 編輯: fauna 來自: 131.215.220.166 (10/09 19:02)
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