Re: [問題]生化的氨基酸排列問題
※ 引述《phy888 (神隱少女)》之銘言：
: A:If a protein with the sequence FEWPRQVDMARINE is treated with
: chymotrypsin, what will the products be
: Chymotrypsin cleavage site: Phe, Trp
: F, EW, PRQVMARINE
: 我知道phe是F Trp是W
: 但是我不知道怎麼切
你都已經知道是切F和W,再查一下是切C端還是N端,就知道為什麼是F、EW,
這個google一下就很多,加油.
: B: What the amino sequence of entire polypeptide
: I. Cyanogen Bromide Treatment:
: 1.DIKQM
: 2.K
: 3.KFAM
: 4.YRGM
: II.Trypsine Hydrolysis
: 5. QMK
: 6. GMDIK
: 7. FAMK
: 8. YR
: CNBr cleavage site: M (Met)
: Trypsin cleavage site: R(Arg), K(Lys)
: The full peptide is :
: Tyr-Arg-Gly-Met-Asp-Ile-Lys-Gln-Met-Lys-Phe-Ala-Met-Lys
: YRGMDIKQMKFAMK
: 然後這一題我不知道怎麼排的?
: 請各位達人指導我 ，感激不盡
先考慮CNBr只切M,所以你得到的sequence1、3、4的尾端都是M,
所以剩下的K,一定是最後一個,否則不會單獨出現.
再從尾端考慮回來,現在的組合是 AA'-MK,
比對sequence5、7,
尾端有可能是 AA'-QMK 或是 AA'-FAMK,
再比對其它sequence,你會得到 YRGMDIKQMK 和 KFAMK,
又Trypsin切完後,不會有單獨的K跑出來,因此KFAMK不會是在前面,
最後只有YRGMDIKQMKFAMK會是正確序列.
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