討論串[問題] DNA序列比對
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推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者andyz (像笨蛋一樣)時間19年前 (2007/03/29 23:37), 編輯資訊
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引述《dreamlife.bbs@bbs.sa.ncyu.edu.tw (我是廢渣)》之銘言:. Windows下 可以用BioEdit 或 Mega. 網頁也有MUSCLE、T-Coffee、MAFFT等等服務. 你可以用Multiple sequence alignment關鍵字查詢相關資料

推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者dreamlife.時間19年前 (2007/03/29 19:07), 編輯資訊
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引述《pcboy.bbs@ptt.cc (妞)》之銘言:. > ───────────────────────────────────────> 我想要比對至少10組以上的DNA序列. > 比較彼此之間的相似性. > 今嘗試用ClustalW. > 不過工作網頁只有一個貼序列的空白方格. >
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推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者gilchang.時間19年前 (2007/03/28 23:45), 編輯資訊
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引述《pcboy.bbs@ptt.cc (妞)》之銘言:. > 我想要比對至少10組以上的DNA序列. > 比較彼此之間的相似性. > 今嘗試用ClustalW. > 不過工作網頁只有一個貼序列的空白方格. > 理論上應該還有其他欲比較序列的空白張貼處. > 請問應該如何使用. > 或是有無方便
(還有288個字)

推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者kuan.時間19年前 (2007/03/28 23:45), 編輯資訊
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它是只有一個貼資料的地方!. 不過它的語法如下:. no1(序列名)>. atcgatcgatcgatcgatcgaaaaaaaaatttttttttccccccccgggggggg. no2(序列名)>. atcgatcgatcgatcgatcgaaaaaaaaatttttttttcccccccc
(還有511個字)

推噓0(0推 0噓 1→)留言1則,0人參與, 最新作者mzac1b (Goodday)時間19年前 (2007/03/27 19:37), 編輯資訊
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我猜你並沒有使用正確的格式. 一個軟體辨識序列有特定的格式需求. 比如說把十多個序列作成 .fasta 格式於一個檔案. 就是很常見的形式. 我用過clustalx 它所能讀取的就是fasta 格式. 如果你只有十多組序列. 其實可以開 .txt 的文字檔自己製作符合該軟體所能讀的格式. 除非序列太
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