RNAlater造成genomic DNA 260/230值過低
大家好
最近在收新鮮腫瘤組織抽genomic DNA，之後預計做bisulfite conversion和NGS
我是將組織常溫保存於RNAlater (Thermo fisher)
並在4小時內就進行DNA抽取
選用的kit為Genedirex DNA isolation kit (tissue)
在RNAlater到貨前，組織是用snap freezing的方式保存
按照kit的protocol做，260/280及260/230皆在理想範圍內
但昨天開始用RNAlater保存組織後，將組織從RNAlater夾出後進行相同DNA extraction步
驟
但做出來的260/230只有1.2左右
我懷疑是RNAlater造成，在處理過程中，原本澄清的上清都變得很混濁......column的膜上
還有大量白色結晶（如圖）
找過資料與官網建議，組織從RNAlater取出後，用kimwipe盡量吸乾多餘RNAlater
我今天照這方法試過
260/230為1.6
過程中的上清仍混濁，column中一樣有白色結晶（但比昨天少了些）
實在是很苦惱
想請教該如何解決RNAlater造成的260/230過低的問題，
謝謝大家！
https://i.imgur.com/GZoohn1.jpg
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推
01/14 03:30,
6年前
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