[求救] PCR問題 以及plasmid濃度換算消失

看板Biotech作者時間8年前 (2016/02/14 02:57), 編輯推噓1(107)
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大家好 因為我不是生科相關科系的 但是因為實驗會牽涉到PCR 所以有些問題想請教...... 我們一直都是用HBV當TEMPLATE (然後用自行設計的機構跑PCR) 只是最近想複製長片段 出現一些問題 跑膠後結果是亮在低於100bp的位置@@ (primer是大於400的) 不管是我們的機台還是傳統機台 所以推測是我們DNA來源沒有那麼長? 那是PRIMER DIMER嗎? 還有其他可能性嗎? 然後請教相關科系學姊 她說可以用plasmid當template 濃度是 0.1mg/ul 這邊我有點不懂...... 因為我們之前都是用例如 10^8 copies/ul 來標記濃度 那這樣我要怎麼轉換?? 我查了一下 鹼基對平均分子量660/mole 我看到有外國類似知識+的論壇有這個回答 https://goo.gl/K5VpxV 可是 660 x 6 billion = 3.96 pico gram (pg) ??? 不懂這是什麼意思? 所以還是想請問有人能淺顯易懂的解說一下嗎QQ 然後更換成這個TEMPLATE後 我們的機台還是跑在低於100bp... 傳統就的確在正確位置了 這樣是anealing extension 時間不夠?? 還是溫度不夠? 溫度太高? 因為短primer是ok的...... 然後還有一個蠢問題 查了一下plasmid 這好像是細菌或酵母菌之類才有的 可是HBV 不是病毒嗎@@? 因為不是學生物的  真的不是很懂這塊  但是還是想要了解基本的 麻煩板友多多指教一下!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 123.194.200.150 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1455389865.A.383.html

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大部分PCR反應 primer都是有很高專一性的
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因此只能放大出特定的目標序列 不會有
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換template產物大小就變了 除非你兩個pri
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mer binding site間有經過裁剪 要p出不同
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大小的產物 最快就是換primer
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但如果條件都ㄧ樣 ㄧ台機器ok ㄧ台不ok
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機器問題較大
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應該是機器問題
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文章代碼(AID): #1MltofE3 (Biotech)