[求救] 如何讓酵素SanDI(KflI)失活!!??

看板Biotech作者 (sharkhsu)時間9年前 (2014/11/23 08:08), 9年前編輯推噓6(6010)
留言16則, 10人參與, 最新討論串1/1
由於實驗上的需求,所以要用到SanDI及另外一種酵素(非快切)去切質體。但SanDI 剩快切有貨,和老師商量後下訂。但在最近要使用時才發現這隻酵素無法熱失活, 說明書上面是建議用phenol/chloroform extraction..不過實驗室裡面並沒有這些 藥品,所以想請問各位前輩,是否有其他的辦法使其失活呢? 現在有考慮過使用plasimd的kit純化,但不曉得可不可行..老師也不太確定 囧 深怕SanDI沒弄乾淨的話,第二支酵素會切不了阿.. -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 114.33.254.149 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1416701297.A.D08.html

11/23 09:11, , 1F
kit 應該是不會保留protein,但也只能試試看
11/23 09:11, 1F

11/23 12:38, , 2F
直接做double digest?
11/23 12:38, 2F

11/23 12:44, , 3F
phenol chloroform 好取得 看這萃取法會不會做而已
11/23 12:44, 3F
是的..現在就是擔心對這手法不熟悉,畢竟後面還要再切第二刀。怕第一次弄完,整個濃 度會掉光..不夠切第二刀.

11/23 14:06, , 4F
苯酚和氯仿今天訂明天就來了 也不貴
11/23 14:06, 4F

11/23 14:14, , 5F
前面就問過了,既然SanDI都買FD的,另一個也有FD版可用阿
11/23 14:14, 5F

11/23 14:17, , 6F
至於要不要HI取決你下一步要做什麼,如果是要跑膠,根本不用
11/23 14:17, 6F
感謝blence大熱心回答,但這兩支酵素似乎沒辦法一起double digest.. 至於切完的話, 是要做ligation用的..

11/23 15:26, , 7F
我這邊跑環安流程訂氯仿用了一個月唷XDD
11/23 15:26, 7F

11/23 16:33, , 8F
phenol/chloroform小量的話直接去找別間實驗室要比較快
11/23 16:33, 8F

11/23 16:34, , 9F
但是超過一定量帶離實驗室一樣要過環安衛
11/23 16:34, 9F
※ 編輯: shunminhsu (114.33.254.149), 11/23/2014 17:11:03

11/23 17:21, , 10F
如果只是ligation,HI需要煩惱嗎?
11/23 17:21, 10F

11/23 17:23, , 11F
你要問非雙切的步驟?還是如何失活? 看起來就不是後者阿
11/23 17:23, 11F
呃..說明書就寫:Optional: Inactivate the enzyme by phenol/chloroform extraction 現在問題卡在不曉得這個步驟是不是必要的..怕酵素如果真的沒失活或拿掉的話會有影響. 因為處理雙切完的plasmid還要用ExoIII下去做反應... ※ 編輯: shunminhsu (114.33.254.149), 11/23/2014 18:36:18

11/23 21:14, , 12F
如果bfr condition是ㄧ高一低的話 可以試試先做低的
11/23 21:14, 12F

11/23 21:15, , 13F
反應完直接補鹽做高的
11/23 21:15, 13F
感謝good大的建議..但一個是快切buffer 另一個是普通buffer 這樣可行嗎!? 酵素好貴阿..不太敢亂浪費XD ※ 編輯: shunminhsu (140.123.126.146), 11/24/2014 09:04:45

11/24 21:32, , 14F
PCR clean up kit
11/24 21:32, 14F
OK 我會試試看的! 只是比較不懂的是.. 其他快切酵素的說明書幾乎都有用kit的步驟, 唯獨這支酵素都沒寫,搞得我好亂阿 冏 ※ 編輯: shunminhsu (140.123.126.146), 11/25/2014 08:41:26

12/02 02:33, , 15F
大不了切一刀跑膠回收再切第二刀
12/02 02:33, 15F

12/14 15:22, , 16F
clean kit or gel extration
12/14 15:22, 16F
文章代碼(AID): #1KSILnq8 (Biotech)