[求救] Lentivirus titer 測定

看板Biotech作者 (平行線上的交集....)時間10年前 (2014/07/19 15:38), 10年前編輯推噓3(3019)
留言22則, 6人參與, 最新討論串1/1
大家好,我是 lentivirus 的新手, 想請問版上操作 lentivirus infection 的版大們, 有無推薦的 kit 或是方法測定 lentivirus 的 titer? 在網路上查到很多家不同的 ELISA p24 antigen kit 和不用抽 RNA 可以快速做 qPCR LTR region 的 kit。 或是用 GFP 類的 reporter 測定 transduction efficiency 也查到 paper 比較分別測定 DNA、RNA 和 protein 量來估計 titer 的方法 (ref. 1) 選擇太多了,不知道哪一個比較適合。 挑幾種買來試試看這種想法應該會直接被碾出實驗室 Orz 我是在化工系的實驗室, 實驗室之前的助理是用體積記錄感染的用量, 結果推算出了轉染率 <0.001% 的實驗記錄。 雖然我看了版上之前的討論文,了解 lentivirus packaging 和 vector size 成反比。 但是用體積來計算實在讓人很崩潰啊 @ @ 和指導教授討論以後希望可以精確地用 MOI 之類的數量化方式來繼續這個實驗。 所以想知道大家平常都是怎麼數量化這個步驟的。 謝謝大家。 ref. 1 http://www.nature.com/gt/journal/v9/n17/full/3301731a.html -- 我們用的 lentivirus vector 是 addgene 的 FUW-OSKM 和 pLOVE 系列, 用 psPAX2 + pMD2.G 在 HEK293FT cell 用 lipo2000 packaging. Packaging 完收的 medium 用 Amicon 100kD 濃縮後,分裝保存在 -80. -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 75.72.204.238 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1405755537.A.E56.html ※ 編輯: silverberry (75.72.204.238), 07/19/2014 15:41:33

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SBI有QPCR KIT...可是夭壽貴
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lab之前是eGFP virus感染293t,推測該批病毒的活性
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不過這種做法當然耗時,也只敢相信10的幾次方這樣的scale
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好處是能知道"活病毒"的量,而不是死活都一起測
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類似二樓 取少量virus感染少量cell看GFP,也有lab是跑qPCR
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感謝樓上,所以如果 vector 沒有 GFP 就要自己做一個
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來當 titer 測定的依據的意思?
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感謝大家的建議
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你的vector有帶任何antibiotics嘛?
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有的話 用96-well plate seed series cell density
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橫向加四種不同的virus量,感染後加藥,讓沒infect的細胞死
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亡,之後數每個well剩多少細胞,劃出curve就可以算出titer了
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不過對不同種類的細胞會不一樣就是
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如果原本沒GFP加了GFP表現量會不一樣 所以也不需要硬加
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可以改用別的方法測 除非以後實驗全都換成有GFP的
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既然要用MOI, 我會用flow cytometry分析GFP細胞比例,
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換算titer
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07/25 12:08, , 18F
謝謝大家的建議。比較完 Kit 和 ELISA 以後,發現
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價格都不太和藹可親。GFP 的部分要跟其他同學討論一下
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目前可能會先參考 paper 設計 LTR 的 primer 做
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minus strong-stop cDNA 的 qPCR。
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先用 viral genome 濃度做參考~
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文章代碼(AID): #1JoY2HvM (Biotech)