[求救] 菌種鑑定 16S rDNA P不出來

看板Biotech作者 (大屁股)時間10年前 (2014/04/22 12:33), 編輯推噓4(406)
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小弟最近在要做乳酸菌菌種鑒定(四株菌) 前面已做過API 50 CHL套組鑑定過生化特性了 菌種鑑定皆為以前學長姐做過的菌種 兩株為L. rhamnosus,另兩株為L. plantrum 也確定他們都有成功(都一次就做好... 所以PRIMER就跟他們用同一組 但是怎麼也P不出來... 想說是不是PRIMER放太久也重新買了一批重跑 由於我們實驗室不是專門做分生 所以也沒對這領域專業的學長姐可以問 但老師要求得做到PCR後才能送定序... 手法問題我也將抽出的DNA測過分光做定量了 然後全程在冰上做 藥劑也抽取完就馬上換TIP 但是奇怪的是只要我P出來有條帶的 他的負控(以無菌水當模板)也會跟著P出條帶... 而另外兩隻plantrum就是乾乾淨淨 什麼條帶都沒有(這組負控沒條帶 想說是不是PRIMER問題 就重新配了一管新的跑出來結果還是一樣 我真的不知道哪裡出問題 方法都照著以前學長姐就是做不出來... 請問板上各位大大能幫我想想辦法嗎? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.127.19.238 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1398141195.A.233.html

04/22 12:39, , 1F
PCR的藥劑換新的看看 操作的藥品和耗材有汙染
04/22 12:39, 1F

04/22 12:53, , 2F
B大 可是另外兩株菌也是用同一批藥劑但是沒條帶
04/22 12:53, 2F

04/22 12:54, , 3F
耗材也是用完就換,這樣應該能排除掉藥劑或耗材問題?
04/22 12:54, 3F

04/22 13:57, , 4F
不然換個水吧 negative有band就很奇怪
04/22 13:57, 4F

04/22 13:58, , 5F
我以前有遇過不同lab的無菌水一個會P出band一個沒有
04/22 13:58, 5F

04/22 22:07, , 6F
無菌水滅兩次看看!! 另外這種不是通常跑colony PCR就
04/22 22:07, 6F

04/22 22:07, , 7F
足夠了?需要到抽DNA嗎?
04/22 22:07, 7F

04/24 20:33, , 8F
聚合酶或buff.有換過嗎?
04/24 20:33, 8F

04/26 01:14, , 9F
買個DEPC-treated 二次水做Negative control. 16S DNA很常
04/26 01:14, 9F

04/26 01:14, , 10F
見於水中。
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文章代碼(AID): #1JLV4B8p (Biotech)