[求救] Western blot的protein似乎卡在well

看板Biotech作者 (Concerto No.2)時間10年前 (2014/03/30 23:03), 10年前編輯推噓4(404)
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目前正在用SDS-PAGE嘗試壓185kD左右的蛋白質, 試過很多次,但每一次的結果都是在250kD以上有很淡且形狀不規則的band, 而且可以另外看到很深色的band緊鄰於well下方。淡band離深色band有一段距離。 然而其他比較小的protein(140以下)情況正常。 抗體的專一性、marker的正確性應該是沒問題, 所以這樣的情況我懷疑是protein aggregate,或是有multiprotein complex卡在gel下 不去,我查到網路上有些人建議不要煮,會使protein aggregate,但是有人卻說煮也 沒關係;有人是說煮完要再離心一次,只取上清(但是這樣濃度不就變了@@);有人建 議用DTT;總之,眾說紛紜…… 不知道各位知不知道什麼方法可以改善這種情況? 謝謝。 -- Protocol如下: 1. 1XRIPA(含proteinase inhibitor)萃取protein:組織搗碎之後sonicate(也試過 不sonicate),4度C離心15min,取上清液,測濃度,加入1XRIPA與sample bfr(含 2-ME)配好每一管sample(80-100ug/well) 2. 100度C水煮5min,on ice 2min 3. load in 7%(也試過8%)的gel,60V 30min,然後轉90V 1hr30min 4. Transfer(濕式) 75V 4hr到PVDF membrane上 5. Blocking 2hr in 5% TBST-milk 室溫 6. 1Ab 1:1000 overnight 4度C 7. TBST wash 10min X3 8. 2Ab 1:1000 1hr 室溫 9. TBST wash 5min X4 10. TBS wash 5min X2 11. ECL呈色 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 61.230.126.111 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1396191806.A.6BF.html ※ 編輯: lacampanella (61.230.126.111), 03/30/2014 23:05:01 ※ 編輯: lacampanella (61.230.126.111), 03/30/2014 23:08:41 ※ 編輯: lacampanella (61.230.126.111), 03/30/2014 23:10:13 ※ 編輯: lacampanella (61.230.126.111), 03/30/2014 23:12:56 ※ 編輯: lacampanella (61.230.126.111), 03/30/2014 23:14:51

03/30 23:16, , 1F
80-100ug/well, 濃度有需要這麼高嗎, 會不會都卡住了啊
03/30 23:16, 1F

03/30 23:18, , 2F
5-20ug/well應該可以應付大部分的狀況, 除非量真的很少
03/30 23:18, 2F

03/30 23:30, , 3F
意思是說濃度太高會卡住?
03/30 23:30, 3F

03/31 01:16, , 4F
我跑過一個350k的 加bete-mercap就一定壓不到
03/31 01:16, 4F
那你是用DTT?

03/31 05:59, , 5F
你跑膠的時間太短dyefront應該才2/3處吧?
03/31 05:59, 5F
已經跑到gel的邊緣了

03/31 06:00, , 6F
至於你的濃度? 你用BCA測嗎??
03/31 06:00, 6F
※ 編輯: lacampanella (61.230.126.111), 03/31/2014 08:04:32

03/31 15:48, , 7F
用rainbow marker, 確定你要的區域有分開, 還要多跑些
03/31 15:48, 7F

03/31 18:32, , 8F
好吧....你sonicate的probe有磨平嗎???
03/31 18:32, 8F
文章代碼(AID): #1JE38-Q_ (Biotech)