[求救] pro 5-alpha 的 Competent cell 製作

看板Biotech作者 (Boy)時間10年前 (2013/11/19 18:14), 編輯推噓2(2018)
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發問時請注意,若是要問實驗相關的問題,請將實驗的步驟、所用的條件大致列出 以方便板友幫您追蹤問題 若是求救事項涉及實驗室智慧財產(例如細胞細菌植株、質體載體等)之分讓, 請務必註明貴實驗室願意設立 正式合作 簽署材料分讓協議(MTA),否則版工將逕行刪除 ----請將上列注意事項以 ctrl + k 刪除後開始編輯文章---- 目前我做Competent cell 菌種是pro 5-alpha 做法是Rubidium Chloride method: 前一天先將菌養在10 ml O/N 隔天1/100加入培養 當A600到達 0.5 冰浴15min左右 用0.4被體積的Tfb I 沖洗,放冰上15 min 左右 再用1/100的 Tfb II 洗 ,放冰上 15min 左右 最後分裝 50 ul,迅速放入液態氮 最後裝盒放 -80度保存 隔天測效率: 分別用濃度 100pg / ul 1 ng / ul 10 ng / ul 的DNA,加入 5ul 冰上靜置30 min,42度heat shock 1 分鐘 迅速放冰上等5分鐘 將細菌放入 1 ml 的LB,培養一小時 取 100 ul 圖盤 結果效率卻只有 5 * 10 ^5 效率頗低。。。 想請問有人做過該菌種嗎? 還是有認為哪一步錯了呢? 謝謝 Orz -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.25.93.195

11/19 18:29, , 1F
對了,5*10^5 效率 是在濃度 10 ng / ul 的DNA中算到
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100 pg / ul , 1 nl / ul的菌落很少,大約5~10顆
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11/19 18:30, , 3F
這是為什麼?? 謝謝
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11/19 23:32, , 4F
我覺得以chemical來說這濃度ok了阿
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11/19 23:54, , 5F
OK嗎? 老師一直說一般來說效率為1*10^7以上
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可是老師也不知道哪個步驟該改進。。。一直無限循環
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efficiency的單位是cfu/ug 換算一下
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我的話前兩部冰浴會再久一點
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efficiency的算法是,數到的菌落/DNA濃度*加入ul量
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舉例來說:10ng/ul,有1000顆
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就是 1000/ 10 * 5 = 20 clone / ng
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然後換算成 clone/ ug = 20000 clone/ ug
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最後因養在1000ul 只取 100ul 塗盤,所以在 * 10
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所以獲得 2 * 10^5 clone / ug 的轉質效率
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有算錯嗎? 對了,其實有試過前兩個步驟放久一點
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可是效果還是一樣 Orz
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re-suspension多次一點效果更好 O.D.0.3左右效率就很高
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0.5有點危險 過了0.5效率會陡降
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想問一下,因為網路上的流程都是Tfb II加0.04倍的體積
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但我們都是加0.01倍的體積,不知道這樣回不會有影響
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文章代碼(AID): #1IYpeAFU (Biotech)