[求救] 植物抽RNA，沒看到18s跟28s

看板Biotech作者 (Epilobium)時間11年前 (2013/06/30 20:42), 編輯推噓3(3推 0噓 7→)
留言10則, 4人參與, 最新討論串1/1
大家好 目前我們實驗室用tri reagent正在抽取植物 (樟科植物，富含醣類的一個類群)RNA 實驗步驟與trizol提供的一致 樣本是較年輕的葉片 但是完成步驟後 看不到18s跟28s rRNA的條帶 樣本的lane也沒什麼smear 但是在相對DNA marker 200-300bps之間，卻有一明顯條帶 看起來就像是5s rRNA的位置? 藥品應該沒有問題 我有嘗試抽取其他醣類比較沒那麼多的物種 (唇形科) 28s 18s跟5s都清楚可見 是因為醣類太多? 或有人有類似的問題否? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.127.28.78
推
07/01 14:29, , 1F
樣本跟reagent不合，抽植物很常碰到的問題
07/01 14:29, 1F
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07/01 14:30, , 2F
樟科植物尤其難抽，一般kit或reagent無法應付很正常~~
07/01 14:30, 2F
推
07/02 21:55, , 3F
用CTAB抽?
07/02 21:55, 3F
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07/02 22:55, , 4F
CTAB應該可以，也可能還是很難抽就是了
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07/03 17:49, , 5F
我好奇為何只有5s沈澱下來?
07/03 17:49, 5F
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07/03 17:50, , 6F
我試過了，ctab可以抽，不過有很明顯的DNA殘留
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07/04 11:50, , 7F
再放DNase吃乾淨就好了
07/04 11:50, 7F
推
07/07 12:18, , 8F
作個RT-PCR一試便知抽RNA結果如何，除非你是要建立cDNA
07/07 12:18, 8F
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07/07 12:21, , 9F
library，如果只是對少數genes有興趣，這種quality測試
07/07 12:21, 9F
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07/07 12:21, , 10F
結果我都只當參考而已。
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