[求救] southern transfer問題

看板Biotech作者 (天災已難防,媒災更煩人)時間11年前 (2013/05/06 18:46), 編輯推噓2(203)
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我最近在做southern,但一直都做不出來 感覺上是transfer出問題。 原本都是用衛生紙裡用毛細現象將DNA轉漬到膜上, 過程: run gel---0.25N HCl 10'---denature 15'*2---nutrolization 15'*2---10 SSC buffer 放膠的方式 (從下而上): gel-膜-圖畫紙-衛生紙-搭一個鹽橋-500 g去壓隔夜 ***此方法一切都很OK,至少都會有band*** 後來想說太慢,實驗室買了一台抽氣transfer機器 品名: Biorad Model 785 Vacuum Blotter 其流程(標準)是: 0.25 N HCl 15'*1---水洗---0.5 N NaOH 30'*1---水洗---10 SSC 90' (5 inch Hg) 做完的結果,只有很淡的marker (我load 10 ul) 連control plasmid也沒有hy到。 1. 因為我的探針有問題嗎? (探針size跑完膠看起來是比control要大) 探針處理是100 C煮沸10分鐘,放入冰上5分鐘。 2. 這樣transfer的效果很好,都沒有殘留,但是DNA會不會被抽到透過膜而跑掉? 3. 我也測試過用原本denature/nutrolization的方式後再加上抽氣,結果一樣。 請問有人用過這樣的方式transfer嗎? 有甚麼辦法可以解決嗎? 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 210.69.175.253

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抽氣式的要注意有沒有縫隙 靠近膠台 可以聽到
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如果有縫隙 會有嘶嘶的聲音 這樣transfer效率會變差
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我個人認為抽氣式沒有傳統好用XDDD
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如果原來的方式很好就不要改條件
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您為什麼這麼著急呢?
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