[方法] 從完整Plasmid取得Vector Alone的方法

看板Biotech作者 (MichaelHsien)時間13年前 (2012/12/10 16:31), 編輯推噓3(305)
留言8則, 4人參與, 最新討論串1/1
最近取得一個plasmid,裏頭已帶有我要的基因 而此基因是利用兩種不同的限制切位所接進去的 但是我沒有vector alone作為實驗的control 所以必須將此plasmid的insert剔除 為了取得這個『空的vector』 請問各位有何較有效率的方法? 我所想到的策略是 將此plasmid進行酶切,以gel extraction取得vector部分... 1. 合成一股帶有此兩限制切位的oligo,酶切後與vector一起Ligation 問題:一般訂購的Oligo(primer?)為ssDNA,要如何自行處理成dsDNA (廠商那邊不知道是否能夠幫我解決此問題) 合成的oligo片段很小,酶切後不知是否能順利回收片段 2. 直接將linear的vector進行Ligation 就像平常cloning時,沒有insert的對照組也會些微self-ligate的情況... 問題:理論上可行,但不知實際效率如何... 不知道這種實驗有何較好的做法呢? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 120.126.57.138 ※ 編輯: michaelhsien 來自: 120.126.57.138 (12/10 16:32)

12/10 17:00, , 1F
fill-in w/Klenow
12/10 17:00, 1F

12/10 17:42, , 2F
第2點,平常self-ligat通常是vector只單切造成,跟你說的無關
12/10 17:42, 2F

12/10 17:44, , 3F
第1點將兩股ssDNA黏成dsDNA,google會有教做法,很容易做
12/10 17:44, 3F
-------------------------------------------------------

12/11 08:41, , 4F
別擔心,這很容易,先用不同的限制脢把insert切出來,跑膠,
12/11 08:41, 4F

12/11 08:45, , 5F
elute,把vector用有proofreading的taq(Pfu),把兩端補齊,
12/11 08:45, 5F

12/11 08:45, , 6F
最後再做ligation就好了
12/11 08:45, 6F
回復CD133: 此reaction只要buffer, 和pfu就好了? 需要加dNTP嗎? 之前有做過類似的實驗,是A tailing...是用Taq pol做的,須外加dATP 另外,之前好像有kit可以直接做blunt end cloning (類似TA cloning的目的) 其中有個反應,可將sticky end反應成blunt end的步驟 我再去查一下好了,謝謝你給我這個ideal ※ 編輯: michaelhsien 來自: 120.126.57.138 (12/13 10:43)

12/15 14:41, , 7F
ssDNA?
12/15 14:41, 7F

12/15 14:41, , 8F
喔喔 了解了
12/15 14:41, 8F
文章代碼(AID): #1GnPtjsu (Biotech)