[求救] knockdown後 RNA下降 protein沒變

看板Biotech作者 (KUMO)時間13年前 (2012/05/19 13:40), 編輯推噓8(8推 0噓 2→)
留言10則, 8人參與, 最新討論串1/1
我利用中研院RNAi core定智客製化病毒後,將keratinocyte的某基因knockdown後 測其RNA表現量,KD後的細胞,該基因表現量只剩不到一成(多次結果都相同) 可是PROTEIN看起來卻完全沒有下降 確認抗體(全長)及PRIMER序列(兩個Varien都有被KD )也都沒問題 請問是哪裡出了問題??? 有什麼原因呢??? 懇求意見 大謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.25.87.42
推
05/19 14:21, , 1F
你要發現大東西了！加油XD
05/19 14:21, 1F
推
05/19 15:07, , 2F
確定蛋白偵測技術(e.q.Western blot)沒有問題?
05/19 15:07, 2F
推
05/19 15:09, , 3F
有沒有可能是QPCR的primer efficiency不好??
05/19 15:09, 3F
推
05/19 16:34, , 4F
protein degradation速率太慢? 所以你跑western測
05/19 16:34, 4F
→
05/19 16:34, , 5F
到的是原本就存在的protein
05/19 16:34, 5F
推
05/19 17:35, , 6F
protein turnover 比較慢?
05/19 17:35, 6F
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05/19 17:36, , 7F
跟樓上說的基本一樣
05/19 17:36, 7F
推
05/19 18:52, , 8F
half-life
05/19 18:52, 8F
推
05/20 20:39, , 9F
可能基因表現還沒反應在蛋白質上 再等久一點看看
05/20 20:39, 9F
推
05/24 09:42, , 10F
Infect完久一點在收(48-72小時後)
05/24 09:42, 10F
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