[求救] Western:Protein ladder消失

看板Biotech作者 (kohkoe)時間14年前 (2012/03/30 03:56), 編輯推噓3(3014)
留言17則, 8人參與, 最新討論串1/1
小弟最近遇到Western的問題, 最近跑SDS-PAGE時protein ladder會在電泳過程中逐漸消失擴散,最後幾乎全不見, 但gel底部的dye很清楚,認為蛋白質應該沒跳海,不過我這幾天開始懷疑了... 以下是transfer前,gel染CBR的圖片 http://ppt.cc/wHDR 如圖所示,左邊ladder約只剩100和70kDa還看得到,其他位置已經不見了;band也變很淡 且很多位置的band都消失了,背景可看到蛋白質跑過的痕跡。 我電泳的條件是, 5% stacking gel, 10% running gel, 定100V跑1小時50分鐘. 蛋白質loading量為40 ug, load體積5 uL的protein ladder及20 uL的samples. 我已排除protein ladder的問題,因為是新買的且有人跑很清楚沒問題。 我running buffer重新配(pH8.3),但近3次跑仍然ladder消失(最後連b-actin都看不到) 目前我認為可能是gel的問題或跑電泳電壓的問題(雖然我之前跑10次以上都沒問題) 請各位大大分析可能的問題,我該如何做? 先用低電壓(60V)再用高電壓(100V)跑嗎?或增加gel的濃度比率? 最後,另想問兩個問題, 1. 即使dye沒跳海,上面的蛋白質有可能先跳海嗎? 2. sample loading的體積會影響跑膠嗎(如load 4 uL和20 uL有差嗎)? 以上 謝謝各位耐心的大大看完我的問題! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.71.94.11 補上transfer後的圖 http://ppt.cc/TptN 可看到ladder的顏色都擴散了,紅色已擴散到下面了。 這時間還在實驗室請各位務必幫小弟troubleshoot 拜託了! ※ 編輯: kohkoe 來自: 203.71.94.11 (03/30 04:53)

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感覺有點像running buffer太熱造成的效果
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如果你其他條件都跟以前一致 那先從做膠的東西開始
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換呢?下膠的buffer, acrylamide這兩個
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膠的buffer我已經配新的了
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band消失有可能是gel過熱? 但我的band跑很平耶
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應該是running buffer太熱,我們之前也有過一樣狀況
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那該怎麼解決? 放冰上跑嗎
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不需放冰上,如果100V還會gel過熱,就要檢查各種buffer配法
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03/30 12:41, , 9F
查過transfer buffer 的ph值了嗎?
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03/30 13:40, , 10F
樓上 我目前問題是卡在跑膠
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03/30 13:42, , 11F
我確認過running buffer配法沒問題...
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03/30 13:48, , 12F
有可能是配膠的10% SDS的問題嗎 這個我沒配新的
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之前我們lab SDS壞掉,跑出來的膠也是很怪
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72 KDa紅色那條跑到95 KDa上面去
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為什麼不換個Ladder試看看
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03/30 17:32, , 16F
最近running或gel prep新配了什麼,就是什麼那個出錯了
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尤其是Tris-HCl最常先用完,然後配新的就出問題
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