[求救] methylation 預測

看板Biotech作者 (草蓆)時間12年前 (2012/03/21 14:07), 編輯推噓2(201)
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我現在有一段序列,預期認為其上面有高度甲基化的情況 因此要探討其甲基化對基因的影響 實驗目前是以傳統方式進行 即 1.bisulfite 2.分析甲基化程度 3. ....... 目前卡在第一步 因此想換個方式,前後一起進行 也就是說 我期望能先預測哪些位置比較有可能被methylation 再由此下去測試 我的問題就是 有辦法進行預測哪些位置會被甲基化嗎? (CpG) 或是有網站可以丟進去分析? 找了一些paper沒有很詳細的說明 或是多是探討別種基因的 有版友知是否有網站分析? 感謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.120.130.105

這是設計MSP的網站 可以利用這方法預測是否會甲基化嗎? (小弟個人理解是應該不能的) 還是大大的意思是指叫我下去跑MSP看看該位置是否會甲基化? ※ 編輯: travelmat 來自: 59.126.67.149 (03/25 18:28)

03/26 18:26, , 2F
她裡面會告訴你 CpG位點 跟 CpG island的位置 至少目前還是
03/26 18:26, 2F

03/26 18:26, , 3F
認為 promoter region的CpG 存在是必要的
03/26 18:26, 3F
文章代碼(AID): #1FQN0b-a (Biotech)