[求救] 得不到insert ....

看板Biotech作者 (CB)時間12年前 (2012/03/02 15:12), 編輯推噓2(2018)
留言20則, 7人參與, 最新討論串1/1
老師要我做construct insert的部分 我先跑PCR 然後拿2ul跑膠check 得到很亮的band 之後PCR產物(38ul)全下去跑膠(load了三個well) 切了120mg的膠去溶 加500ul的GEX buffer 最後用60ul的60度C水去elute 之後跑膠check 照膠結果亮度變得很普通 接著取42.5ul的elution 用XhoI 2.5ul去切 切完之後全下跑電泳 照膠結果 雖然滿淡的 不過用GeneSnap去看還滿清楚的 切膠機下則是勉強看的到 切膠時 膠有260mg 所以我分兩管elute 各加500ul GEX buffer 最後各用35ul水去elute 但是 我取5ul去check時 卻根本沒有東西 >.< 去測DNA濃度 竟然還是負的Orz 我切膠的過程 都是照protocol上走 不過 我發現elute時即使水下在膜中央 水滴還是會歪一邊= = 然後就沒有全都包覆到膜 就會懷疑那半邊的DNA有沒有下來 不知道大家有沒有經驗 能夠幫忙敝人改正錯誤 得到insert呢? 另外想問一下有沒有人的實驗室是用一種不用gel extraction 而是直接用吸起來的電泳槽? 不知道那個要多少錢呢? 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.235.109

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切膠回收率有2/3就可以偷笑了 連做兩次就越來越低..
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RE完直接做purification 現在很多kit gel extration
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跟purification都用同一組 去看一下protocol吧
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有些gel extraction manual有寫,低於50ul水,elute效率更減
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不過我的產品說明上面說15~30ul為佳耶QQ
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請問purification和 gel extraction有啥不一樣嗎?QQ
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我們實驗室兩個名詞好像指的都一樣的東西
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purificationg是指PCR完或者RE完 直接加入binding bu
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ff(每家廠商名稱都不一樣)混合均勻後過spin column
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->wash->elute 可以拿到濃度較高的sample, insert部
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分用RE切下來的bp少 用跑膠分不出哪些沒切哪些有切
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而且量又不像vector可以一次大量取 所以vector 部分
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RE完會做切膠純化 insert部分就直接純化
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我也是一直碰到差不多的問題,elution後濃度低到誇張
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03/02 18:05, , 15F
我們實驗室有Gene-Spin這產品 請問是purification嗎?
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03/02 23:11, , 16F
insert別做gel extration 我已經發生很多次慘案...
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尤其越短的回收率越低...
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其實你的東西還在 只是低到用膠看不到
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03/04 16:03, , 19F
不要跑膠直接回收吧
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03/20 11:57, , 20F
不要在R.E.作用前做膠回收,會切不好。
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文章代碼(AID): #1FK7BPOV (Biotech)