[求救] 有關site-directed mutagenesis

看板Biotech作者 (016)時間14年前 (2011/12/16 01:36), 編輯推噓6(603)
留言9則, 6人參與, 最新討論串1/1
發問時請注意,若是要問實驗相關的問題,請將實驗的步驟、所用的條件大致列出 以方便板友幫您追蹤問題 ----請將上列注意事項以 ctrl + k 刪除後開始編輯文章---- 板上各位前輩大家晚安~~~ 小弟最近在作site-directed mutagenesis 但是一直遇到個問題.... 跑完PCR後 會用Dpn 1在37度下切個一小時 然後跑Agarose Gel 確認一下大小~ 跑出來的結果在預期的地方(6K)看不到band?? 但是在1K那卻有Band?? 這..到底是發生了什麼事?? 是PCR沒有作到我要放大的基因嗎?? 還是primer亂黏?? 這樣我還需要transformation到DH-5 alpha嗎?? (感覺作了也長不出colony....~"~) (小弟用的vector是pET30(約6K左右);promoter是T7 promoter) 附上小弟的PCR的材料... 5uL 10xpfu buffer 1uL Primer Forward 1uL Primer Reverse 5uL dNTP(因為放-20度C有點時間了~所以想說多加一點) 15uL Plasmid(因為濃度有點低~所以才多放一點@@) 22uL dd-water(滅過菌的) 1uL pfu polymerase ------------------------------------------------------ Total 50uL PCR的condition如下.... 95度C Pre-heating 95度C 30秒 55度C 1分鐘 68度C 10分鐘(看protocol是寫1kb/mins) 共12cycle~ 不知道板上的前輩們能不能給晚輩我一點建議... 或是有哪個步驟作錯了 (少加什麼?或不該加什麼?) 懇請給予小弟指導~~ 拜託大家了 > < 謝謝~~~~~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.113.63.243

12/16 11:16, , 1F
請把濃度也附上,另外12 cycle不會太少嗎?
12/16 11:16, 1F

12/16 11:17, , 2F
你確定P出來的是1K嗎? 還是primer dimer?
12/16 11:17, 2F

12/16 11:34, , 3F
圖?
12/16 11:34, 3F

12/16 13:22, , 4F
primer length and Tm?
12/16 13:22, 4F

12/16 15:41, , 5F
TM時間用30秒就可了吧? 68度?不用72度跑6分鐘就好吧?
12/16 15:41, 5F

12/16 15:41, , 6F
12cycle太少了25比較好
12/16 15:41, 6F

12/16 15:52, , 7F
我覺得要看到很難ㄟ..坐坐看transformation吧!!
12/16 15:52, 7F

12/16 18:06, , 8F
總template量建議小於50ng,然後跑20-25個cycles看看
12/16 18:06, 8F

12/16 18:07, , 9F
Quikchange的product量較少,在DNA gel上不一定看得到產物
12/16 18:07, 9F
文章代碼(AID): #1EwZ0tUy (Biotech)