[求救] GSEA (Gene set enrichment analysis)
Gene set enrichment analysis (GSEA)
是一種基因集分析方法
主要是先在2003由 Mootha提出
陸續在2005被Subramanian修正發表在PNAS
"Gene set enrichment analysis: A knowledge-based
approach for interpreting genome-wide expression profiles"
不過話說這個在量化比較不同基因的表現量差異時
ES(enrichment score)值 和NES(Normalized enrichment score) 值
或 FDR(false discovery rate)怎麼算出來
我真的是有看沒有懂 跟天書一樣QQ
只大概了解圖所解釋出來的趨勢
和FDR < 0.25就算有顯著關係
不知道有沒有這方面的專家能提供一點資訊
主要是在一開始Gene set S的規則
非常感謝<(_ _)>
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