[討論] 求救高手解答microsatellite typing analysis

看板Biotech作者 (巴豆妖)時間12年前 (2011/10/01 04:11), 編輯推噓2(2推 0噓 14→)
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最近看了一篇期刊 當中用 microsatellite typing analysis的方式去偵測NPC細胞的deletion現象 他應該是要告訴我們在NPC中,發生DELETION是常見的現象 結果如圖:http://ppt.cc/fqgy 這個方式的原理好像也是利用PCR的方式 而結果中圖的縱軸應該是螢光物質、橫軸似乎是Allele號碼但不確定 那我想請問一下如何看這張圖了解CNE1和C666是homozygous而NP69和NP460是 heterozygous呢? 並且CNE1和C666雖然都是homozygous,但是他的橫軸位置好像不一樣? 請高手幫忙解答一下,謝 ps:CNE1和C666都是NPC Cell line NP69和NP460都是NP Cell line -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 123.194.52.213
推
10/01 08:30, , 1F
其實就是homozygosity mapping.若是連續出現
10/01 08:30, 1F
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10/01 08:31, , 2F
homozygous的genotye,代表該區域極有可能產生缺失.
10/01 08:31, 2F
推
10/01 09:57, , 3F
這個是用兩種taqman probe去做的吧~兩種螢光label
10/01 09:57, 3F
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10/01 12:46, , 4F
那我想請問一下橫軸是什麼@@?另外CNE和C666雖然都是HOMO
10/01 12:46, 4F
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10/01 12:46, , 5F
但是他的橫軸位置不一樣...是不是有什麼不一樣??
10/01 12:46, 5F
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10/01 12:47, , 6F
畢竟都是homo也有可能有兩個allele都沒有被deletion跟
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10/01 12:47, , 7F
皆有被deletion
10/01 12:47, 7F
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10/01 12:51, , 8F
因為micosatellite的allele很多,會連續出現homozygous
10/01 12:51, 8F
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10/01 12:52, , 9F
的機率就不會很大,因此看到連續出現,就可能有deletion
10/01 12:52, 9F
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10/01 12:55, , 10F
還有都是deletion的話,不會有genotype出來
10/01 12:55, 10F
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10/01 13:05, , 11F
恩恩~~可是這樣我只了解左邊的圖的意思!!那請問一下右邊
10/01 13:05, 11F
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10/01 13:06, , 12F
圖要怎麼看呀!!CNE和C666橫軸不一樣的原因是??
10/01 13:06, 12F
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10/01 13:06, , 13F
又為什麼heterozygous就會有兩個peak@@?
10/01 13:06, 13F
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10/01 13:07, , 14F
不好意思喔@@一直麻煩你qq
10/01 13:07, 14F
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10/01 13:14, , 15F
你應該先了解什麼是microsatellite marker,就會知道
10/01 13:14, 15F
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10/01 13:15, , 16F
為何heterozygous會有2個peaks
10/01 13:15, 16F
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