[問題] CpG island 的定義

看板Biotech作者 (阿杰)時間12年前 (2011/08/04 16:14), 編輯推噓0(0推 0噓 3→)
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CpG island的定義可能有不同的版本 我查到的一個版本如下 A 500 base pair window with a G+C content of at least 55% and an observed/expected CpG frequency of at least 0.65. 想請教的是 55%那個很好懂 但是observed/expected CpG frequency 至少要0.65這部分 所謂的expected CpG是怎麼決定的? 不知道是否有人對這個領域熟悉的可以協助 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.1.187
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08/04 16:51, , 1F
將ATCG排成n個bp所產生的隨機序列中,恰巧含有CG順序的比例
08/04 16:51, 1F
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08/04 16:57, , 2F
如果n=2,機率只有1/16,隨著n增加,應該會趨近1/4
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08/04 17:46, , 3F
感謝您!
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