[求救] 利用IP-->Mass 的方式探討protein-protein interaction

看板Biotech作者 (sam)時間13年前 (2011/03/23 23:40), 編輯推噓3(3推 0噓 6→)
留言9則, 3人參與, 最新討論串1/1
各位大大好 不知道有沒有人做過 將culture cell內的某protein IP下來 然後上Mass (shotgun proteomics) 來看哪些protein與某protein有interaction呢? 小弟目前求助無門 有以下疑惑 1.將protein IP下來後不知道要選哪種elution buffer較適合後面上質譜儀? 目前已知有 1.Glycin (pH 2) 2.1%SDS 3.Urea 2.Cell的量要多嗎? 3.建議上哪種質譜儀呢? LC-tandem-MS or MALDI-TOF? 希望有經驗的大大可以分享經驗QQ 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 114.24.71.164
推
03/29 15:37, , 1F
如果是做LC/MS,protein抓下來之後直接送去打應該可以!!
03/29 15:37, 1F
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03/29 15:38, , 2F
但MALDI-TOF不太清楚,你可以問幫你做分析的人!
03/29 15:38, 2F
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03/29 15:39, , 3F
我自己是做CO-IP之後跑2D所以沒有這樣的困惱><"
03/29 15:39, 3F
推
04/06 18:57, , 4F
你的東西不夠純的話:LC/MS(Maldi-TOF需要夠純)，細節問題
04/06 18:57, 4F
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04/06 18:59, , 5F
建議直接寫信請教相關實驗室，或是直接問未來送LC/MS的單位
04/06 18:59, 5F
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04/06 18:59, , 6F
可以收穫很多，他們有時也會給你建議或策略
04/06 18:59, 6F
推
04/05 22:18, , 7F
你要先決定要做in gel 還是 in solution digestion
04/05 22:18, 7F
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04/05 22:19, , 8F
如果是in gel就要先跑膠，再挖band。in solution的話，
04/05 22:19, 8F
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04/05 22:19, , 9F
我建議你問相關實驗室
04/05 22:19, 9F
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