如何預測protein binding site?

看板Biotech作者 (迷思)時間15年前 (2011/03/16 11:13), 編輯推噓0(005)
留言5則, 2人參與, 最新討論串1/1
我手上有一的蛋白,我有他的amino acid sequence 我想要知道這個蛋白有沒有可能的binding site可以與其他的蛋白進行interaction, 我想要找一些生物資訊軟體,可以幫我作預測分析。 可不可以請大家給一點建議?謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.253.121

03/16 12:41, , 1F
或許可參考交大生資所楊進木老師網頁
03/16 12:41, 1F

04/06 19:01, , 2F
NCBI sequence blast,找高序列相似度蛋白,比對其已知的
04/06 19:01, 2F

04/06 19:02, , 3F
binding site
04/06 19:02, 3F

04/06 19:03, , 4F
如果interaction protein有對象了的話,docking modeling
04/06 19:03, 4F

04/06 19:03, , 5F
沒做過 聽說docking不好作 (以上純屬個人淺見
04/06 19:03, 5F
文章代碼(AID): #1DW2hor5 (Biotech)