[問題] 請教一個關於intron loss的問題

看板Biotech作者 (小熊維尼的天才老爹)時間15年前 (2011/02/15 11:22), 編輯推噓0(002)
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※ [本文轉錄自 Biology 看板 #1DMV5WU4 ] 作者: WinnieDad (小熊維尼的天才老爹) 看板: Biology 標題: [問題] 請教一個關於intron loss的問題 時間: Tue Feb 15 11:22:06 2011 【問題】:已定序的intron loss event,可否僅是PCR時amplified到被轉譯的基因      片段,而非真正的lost intron 【問題起因】:小弟於研究中發現到幾個intron loss events並且得到該intron完全        切除的定序結果,為之興奮不已。但是有教授質疑此結果可能是我做        PCR時複製到剛好已完成轉譯的片段。 【個人看法】:由於整個DNA extraction過程中都有小心做RNase處理,理論上應該        不會發生轉譯完成的mRNA存在又被RT成cDNA後在PCR時增幅。另外;        跑膠的結果也都只有單一條cDNA size的band而已,如果是教授所說        的情況發生,應該會看到原本的基因片段和無intron的片段兩條bands        同時存在。我用以上這兩點解釋時是蠻有信心的,可是教授一直在奸        笑,笑的我心發寒… -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.16.202 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.16.202

02/15 13:07, , 1F
多設計幾組primer驗證 比如跨intron或是跨exon的primer
02/15 13:07, 1F

02/15 13:25, , 2F
我的primers本身就是依附exons而跨intron(s)的。
02/15 13:25, 2F
文章代碼(AID): #1DMV63Wd (Biotech)