[求救] 未知序列的物種promotor找尋

看板Biotech作者 (~（⊙ｏ⊙）~)時間15年前 (2010/12/16 21:23), 編輯推噓4(4推 0噓 3→)
留言7則, 5人參與, 最新討論串1/1
想請問如果要在未知(未定序)序列的物種中找到他的promotor 是否可用5' RACE PCR 或是有其他方法可以得到 基本上是以真菌類(無intron的genomic DNA)的情形 如果已知其cDNA 是否可直接設計反向的primer做sequence就可以得到上游的promotor區域? 以上請教大家,多謝 -- -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.109.40.29
推
12/16 21:49, , 1F
5' RACE 只能做到cds的部分 還是要用genome walker 才行
12/16 21:49, 1F
→
12/16 22:06, , 2F
mRNA是從+1開始吧 promoter有一大半都在前面勒
12/16 22:06, 2F
→
12/17 10:07, , 3F
5' RACE 可以做到5'UTR 不是只能做到CDS部分
12/17 10:07, 3F
推
12/17 10:23, , 4F
所以應該說5'RACE是對ORF的起點作search~是嗎?!
12/17 10:23, 4F
推
12/17 18:40, , 5F
transcription start site比ORF多一段喔 翻翻分生唄
12/17 18:40, 5F
推
12/18 00:49, , 6F
真菌不是有intron? 我記錯哩嗎@@...
12/18 00:49, 6F
→
12/18 13:31, , 7F
細菌沒有XD 真菌應該有吧
12/18 13:31, 7F
‣ 更多 kingtiger 的文章
文章代碼(AID): #1D2XAv7w (Biotech)