[求救] 我的PCR有Negative control的問題?
各位大大
我最近跑PCR的negative control都會有band,我們實驗室其他人也都遇到一樣的問題
而且band的大小每個人都不一樣,都剛剛好跟自己主要sample P出來的大小一樣
我試了一些方法想找出原因,但是結果越來越奇怪
我先說明一下大致的方法:
我的negative control是用DDW(滅過菌並分裝)當template
兩股primer也都會從stock中分裝出來,primer夾出來片段的大小約900bp
Taq酵素的使用非常頻繁,應該不會有汙染的狀況
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實驗的材料做一個說明
我的DDW分為 舊DDW(原本使用的)及新DDW(新分裝到tube中)
primer分為 舊primer及新primer
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第一個實驗:有加我的樣品一起跑,但是NC都是先加的
NC:舊DDW+舊primer
結果:NC跟我的樣品跑出一樣大小的band
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第二個實驗:純粹跑舊DDW+舊primer (不加其他sample) 跑11管
結果:全部都有大約900bp淡淡的band
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第三個實驗:有舊DDW.新DDW+舊primer.新primer
sample 結果(O.X) O代表有band;X代表沒有band
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1.舊DDW+新primer F+R X
2.舊DDW+新primer F X
3.舊DDW+新primer R X
4.舊DDW X
5.新DDW X
6.新DDW+舊primer F+R O
7.新DDW+新primer F+R O
所以懷疑是新的水有汙染
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第四個實驗:
sample 結果
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1.舊DDW+舊primer F+R X -與第1.2次實驗不符
2.舊DDW+新primer F+R O -與第3次實驗不符
3.新DDW+舊primer F+R O
4.新DDW+新primer F+R O
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真的非常感謝耐心看完以上內容的大家
我寫的不知道大家有沒有了解
如果看懂我打的內容,希望可以給我一些建議
因為要做分析實驗,所以需要NC
如果解決不了,其他的data都不準確
拜託!!拜託!!
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 61.227.162.43
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