[求救] 關於RNAi的機制問題

看板Biotech作者 (Jennifer)時間13年前 (2010/10/21 20:55), 編輯推噓2(201)
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大家好 我遇到了一個關於RNAi機制的問題 我的target protein有兩個長度不同的isoforms 簡稱他們為A和B B和A的序列基本上是一樣的 差別在於B在A的3端接近stop codon的地方插入了38個mer 使得B的stop codon延後出現 比A多出了四百多了mer 前陣子我發現我所使用的RNAi序列 幾乎都是target在這多出來的四百多個mer之中 我們的考量是此RNAi雖然也會認到A 但是經RNAi作用切除以後 A還是保有完整的序列從start到stop 一些書籍裡面只提到在RNAi做用完以後 不完整的RNA會接著被其他機制給分解掉 不知道大家有沒有遇過類似的狀況呢? 所以想問請問一下大家認為 我的RNAi是否會抑制到A表現呢? 先謝謝大家看完我這個冗長的解說了! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 118.169.33.63

10/22 05:54, , 1F
是在3'UTR的意思嗎? 這個有意思了XD
10/22 05:54, 1F

10/22 12:06, , 2F
會 3'UTR被摧毀polyA就沒了 translation和half life都會下降
10/22 12:06, 2F

10/22 12:07, , 3F
事實上 作用在3'UTR的siRNA/shRNA經常使用在rescue的實驗中
10/22 12:07, 3F
文章代碼(AID): #1Cm3XPOk (Biotech)