[求救] 如何在cDNA中移除已經reverse transcript的tRNA和rRNA?

看板Biotech作者 (無聊就是力量)時間15年前 (2010/09/22 02:08), 編輯推噓4(4推 0噓 5→)
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各位版友先進好 我最近在做環境的cDNA library， 但是抽完RNA以及反轉錄好所有的cDNA後(我是用random hexamers做cDNA)， 才發現這裡的cDNA可能還包括很多rRNA和tRNA， 可是如果要定序， 這樣會花太多錢在定rRNA和tRNA上， 而我的主要目標是mRNA。 然而查閱文獻資料後， 發現大部分的方法都是在轉成cDNA之前就已經清除了那些rRNA和tRNA了， 所以想請教一下， 有沒有什麼方法是可以在合成cDNA後再清除的? 感謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 142.157.130.197
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09/22 03:32, , 1F
我是家RNaes, 我用qiagen的cdna kit裡面有副
09/22 03:32, 1F
推
09/22 10:14, , 2F
為何不再做一次用polyA primer轉cDNA就好,會比較快吧
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09/22 15:11, , 3F
T
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推
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或許原po是做細菌的？？
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09/22 16:02, , 5F
嗯...不過細菌應該不是做cDNA啦～我耍笨了XD
09/22 16:02, 5F
推
09/22 17:08, , 6F
1.用olido-dT作RT。2.若非得用radom primer作RT，那把RNA過
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oligo-dT column純化mRNA
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對我是target原核生物，所以沒有polyA.....
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09/22 23:27, , 9F
抱歉造成誤解，我應該用ssDNA來描述而不是用cDNA。
09/22 23:27, 9F
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