Re: [求救] 基因序列註冊

看板Biotech作者 (~四條魚~)時間15年前 (2010/09/07 16:17), 編輯推噓1(101)
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我兩年前註冊過序列... 現在記憶也快沒了..XD 但我試著解釋一下你遇到的問題 希望對你有幫助 因為NCBI是種綜合的資料庫 可以查詢Protein, Nucleotide, EST等等序列資料 因此當註冊序列時 需要說明你要上傳的是何種序列 以利資料庫的合併與整理 從你的敘述來看 你應該是沒告知GenBank你的序列是屬於哪一種序列 所以系統要求確認並選擇你的序列種類: 1.你的序列如果是可轉錄轉譯的,包括蛋白質序列、DNA基因序列等 應該在第一項 Coding Region(s) 加入你的序列數量 2.你的序列如果屬於RNA的序列,那應該在第二項 RNA Features(s) 輸入 (我想它說明也很清楚 包括哪類的RNA序列了) 3.如果是其他類的序列 例如:promoter、repeat element、UTR、intron和exon等 如果我沒記錯的話... 每一項加入時 應該會再詢問你序列類型跟範圍吧 舉個例子來說: 如果你的序列是一條你們實驗室新定序出來的"完整的DNA基因序列" 圖例 promoter UTR exon1 intron exon2 UTR DNA +==========+=====+=======+=========+=======+=======+ 那應該要輸入 1 coding region (gene) 6 other features (promoter, UTR x2, exon x2, intron) ㄟ都...更詳細一點的話 應該要再輸入mRNA跟protein的序列 另外 若有些分類你不太清楚 也可以參考NCBI中其他的序列 FEATURES的部份 以上 如有錯誤或缺失的地方 還煩請近來用過的人指正摟!XD ※ 引述《BarryJones (伊果邦)》之銘言: : 大家好 : 小弟目前手上有一條基因序列必須註冊 : 使用的是NCBI的blankit : 但是由於沒有註冊經驗 : 因此遇到了以下問題 : 當我其它表格皆填寫完畢後 : 網頁出現的字如下: : **** You're not finished yet! **** : -------------------------------------------------------------------------------- : Review your entry below, then choose either Modify Submission or Submit to : GenBank. : To add coding regions and other features, or to make corrections, enter the : number of features you wish to add. Then press the Modify Submission button : to return to the submission form. : Add ( 0 ) Coding Region(s) (Includes information about proteins, genes, mRNA : intervals) : The protein sequence and related information are among the most important : and useful components of a sequence entry - if these are available, please : include them! : Add ( 0 ) RNA Features(s) (premessage RNA, mRNA, tRNA, rRNA, ncRNA, tmRNA, : other/miscRNA) : Add ( 0 ) Other Feature(s) (includes exons, introns, repeat elements, UTRs, etc.) : <Modify Submission> <按鍵處> : Your Entry is NOT complete until you press Submit to GenBank. : <Submit to genebank> Submit final draft. LAST STEP! (Please do this only once for each sequence : submitted.) : ---------------------------- : ()中的"0"是可以填入數字作修改 : 不知道有沒有人也遇過雷同的事呢??? : 可否傳授經驗以解決小弟的問題!!! : 非常感謝!!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.94.157

09/07 16:20, , 1F
PS.如果沒有promoter這項 那應該併入UTR這部份 數量要-1
09/07 16:20, 1F

09/08 20:45, , 2F
四條魚~感謝您~我會針對你的建議再註冊一次~謝謝!!!
09/08 20:45, 2F
文章代碼(AID): #1CXVK98c (Biotech)