Re: [求救] 基因序列註冊
我兩年前註冊過序列...
現在記憶也快沒了..XD
但我試著解釋一下你遇到的問題 希望對你有幫助
因為NCBI是種綜合的資料庫 可以查詢Protein, Nucleotide, EST等等序列資料
因此當註冊序列時 需要說明你要上傳的是何種序列 以利資料庫的合併與整理
從你的敘述來看 你應該是沒告知GenBank你的序列是屬於哪一種序列
所以系統要求確認並選擇你的序列種類:
1.你的序列如果是可轉錄轉譯的,包括蛋白質序列、DNA基因序列等
應該在第一項 Coding Region(s) 加入你的序列數量
2.你的序列如果屬於RNA的序列,那應該在第二項 RNA Features(s) 輸入
(我想它說明也很清楚 包括哪類的RNA序列了)
3.如果是其他類的序列 例如:promoter、repeat element、UTR、intron和exon等
如果我沒記錯的話...
每一項加入時 應該會再詢問你序列類型跟範圍吧
舉個例子來說:
如果你的序列是一條你們實驗室新定序出來的"完整的DNA基因序列"
圖例
promoter UTR exon1 intron exon2 UTR
DNA +==========+=====+=======+=========+=======+=======+
那應該要輸入
1 coding region (gene)
6 other features (promoter, UTR x2, exon x2, intron)
ㄟ都...更詳細一點的話 應該要再輸入mRNA跟protein的序列
另外 若有些分類你不太清楚 也可以參考NCBI中其他的序列 FEATURES的部份
以上
如有錯誤或缺失的地方 還煩請近來用過的人指正摟!XD
※ 引述《BarryJones (伊果邦)》之銘言:
: 大家好
: 小弟目前手上有一條基因序列必須註冊
: 使用的是NCBI的blankit
: 但是由於沒有註冊經驗
: 因此遇到了以下問題
: 當我其它表格皆填寫完畢後
: 網頁出現的字如下:
: **** You're not finished yet! ****
: --------------------------------------------------------------------------------
: Review your entry below, then choose either Modify Submission or Submit to
: GenBank.
: To add coding regions and other features, or to make corrections, enter the
: number of features you wish to add. Then press the Modify Submission button
: to return to the submission form.
: Add ( 0 ) Coding Region(s) (Includes information about proteins, genes, mRNA
: intervals)
: The protein sequence and related information are among the most important
: and useful components of a sequence entry - if these are available, please
: include them!
: Add ( 0 ) RNA Features(s) (premessage RNA, mRNA, tRNA, rRNA, ncRNA, tmRNA,
: other/miscRNA)
: Add ( 0 ) Other Feature(s) (includes exons, introns, repeat elements, UTRs, etc.)
: <Modify Submission> <按鍵處>
: Your Entry is NOT complete until you press Submit to GenBank.
: <Submit to genebank> Submit final draft. LAST STEP! (Please do this only once for each sequence
: submitted.)
: ----------------------------
: ()中的"0"是可以填入數字作修改
: 不知道有沒有人也遇過雷同的事呢???
: 可否傳授經驗以解決小弟的問題!!!
: 非常感謝!!!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.94.157
→
09/07 16:20, , 1F
09/07 16:20, 1F
推
09/08 20:45, , 2F
09/08 20:45, 2F