[求救] DNA基因片段pcr無法擴增

看板Biotech作者 (tRoMboNe pLaYer)時間15年前 (2010/08/20 00:15), 編輯推噓2(2013)
留言15則, 5人參與, 最新討論串1/1
各位好 我想要求救的問題是: 我進行一段DNA片段的PCR擴增 已經試了一段時間了 完全沒有辦法擴增出來 但是我對該基因進行 RT-PCR 擴增是沒有問題的 以相同的primer進行DNA的擴增卻無法擴增 更奇怪的是 我把該DNA片段 拆成兩段作PCR卻可以做出來 例如 該片段總長度為2000 bp 由1-1500 可以做出來 由1400-2000可以做出來 可是做1-2000卻不行 真的很奇怪 不知道各位先進有沒有什麼看法 請大家指教 我的pcr條件: 94 C 5 min 94 C 1.5 min } 60 C 1 min } 72 C 2.5 min } 40cycle 72 C 5 min 基本上以2k 的長度應該一定要可以才對 但是做不出來 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 111.242.135.19

08/20 00:17, , 1F
忘記說 我用的酵素是 C牌的 advantage 2
08/20 00:17, 1F

08/20 00:34, , 2F
妳可以把1.5 mins 調成 2.0 mins
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再者,妳跑那麼多cycle幹嘛??30就夠了啦
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08/20 00:35, , 4F
不信妳可以去測,妳跑高於30妳的PCR產物也不會高到哪去
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= ="因為怕放不出來...才會做這麼多cycle
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因為酵素沒法這麼耐,除非妳跑到一半加酵素
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08/20 00:38, , 7F
恩恩 謝謝你的意見 我會試試看~^^
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08/20 09:59, , 8F
會不會兩各primer的Tm值差太多..
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08/20 18:20, , 9F
既然分成兩段做得出來就分開跑好再混在一起吧XD(誤)
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08/20 18:21, , 10F
混起來再跑一次全長?
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08/22 01:57, , 11F
如果分開放 我想必須要先用限制酶切過 再做ligation
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才能再放全長 這個部分我做過 之前沒成功
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08/22 01:58, , 13F
但理論上DNA一定要放得出來才對...
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08/25 12:29, , 14F
請教一下 你有沒有考慮到intron的問題?確定一下primer是
08/25 12:29, 14F

08/25 12:30, , 15F
不是跨exons 另外94度降到30s就夠了 煮太久對酵素也不好
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文章代碼(AID): #1CRLYeLw (Biotech)