[求救] Western 的 band 黏合 + 形狀不佳 (附圖)

看板Biotech作者 (好魚)時間14年前 (2010/08/05 21:20), 編輯推噓2(203)
留言5則, 3人參與, 最新討論串1/1
大家好,敝人做 Western blot 時 在最近觀察到自己的 beta-actin 常會黏在一起 而不是很 sharp 的分開,下文附圖 我是用老鼠大腦為組織,為了偵測 c-Fos 的表現 50 ug / ml 的濃度(低於 40 ug / ml 就偵測不到 c-Fos) 條件如下 =============================================================== Loading 前處理 || 加入 dye 後,攝氏 80 - 90 度,煮 5 分鐘 Gel || 8% SDS-PAGE Electrophoresis || Stacking gel: 80V, RT, 20 min Separation gel: 130V, RT, ~40 min Transfer || 400 mA, 冰浴, 2 hr Blocking || 5% milk in TTBS, RT, 1 hr Primary Ab || Beta-actin: 1/2500, RT, O/N c-Fos: 1/2000, RT, O/N Secondary Ab || Beta-actin: 1/5000, RT, 1 hr c-Fos: 1/3000, RT, 1 hr Wash || TTBS RT, 5 min 5 min 15 min =============================================================== c-Fos: ~ 60 kD Beta-actin: 43 kD http://tinyurl.com/2ewrxvx 這張圖是用 ECL 冷光呈色 270 秒以後得到的結果 可看到 beta actin 的邊緣有所沾連 而且不是完整的扁平形狀(近似W形鋸齒) c-Fos 形狀則比 beta actin 漂亮得多 至於 lane 2 東西很少是因為裡面有沒 sonicate 乾淨的 DNA(電泳時就可見到一坨) http://tinyurl.com/23ucpp9 這張則是 ECL 冷光呈色 250 秒以後得到的結果 beta actin 彼此有分開,但形狀仍然帶有鋸齒 想請教板上各位高手 是否能給敝人一點修改的建議 老闆想拿實驗結果投稿 不過敝人認為這樣子難看的 beta actin 恐怕不太適合當 representative figure 看到壁報上那些乾乾淨淨的 band 心裡就好癢 ~"~ 個人在猜想會不會是因為 beta actin 的一抗加太濃?? 因為先前有用過 1/5000 的,結果 beta actin 訊號不強 所以後來敝人都是用 1/2500 的濃度加一抗 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.121.239 ※ 編輯: goodfish700 來自: 140.112.121.239 (08/05 21:21)

08/06 11:11, , 1F
用10% gel ,電泳第二步改100v
08/06 11:11, 1F

08/06 18:31, , 2F
配gel的溶液是否有變質?或是凝不完全?separating用100V
08/06 18:31, 2F

08/07 04:15, , 3F
同樓上,注意tris buf.是否有變質,pH是否正確
08/07 04:15, 3F

08/07 04:16, , 4F
也確認running buffer是否有問題,配方是不是正確
08/07 04:16, 4F

08/07 04:16, , 5F
還有sample dye是否有變質...建議全部重配比較快!
08/07 04:16, 5F
文章代碼(AID): #1CMhgO6p (Biotech)