[求救] gene expression database

看板Biotech作者 (Lab Pub Orz...)時間15年前 (2010/07/20 23:18), 編輯推噓3(3推 0噓 10→)
留言13則, 6人參與, 最新討論串1/1
我想請問有沒有database 是可以查gene在各個cell line裡的expression情形 我通常都會上UCSC去找資料 不過那裡只能找到在normal tissue的expression array 所以想問一下有沒有別的database 是有整理各個gene在各個現存的cell line裡的expression profile 煩請指教，謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 122.121.205.216
推
07/21 00:20, , 1F
其實我看不太懂,但是NCBI有個OMIM(在右邊的選項)
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07/21 00:21, , 2F
填入gene後可以看到大概的研究方向還有reference
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07/21 08:35, , 3F
喔，我的意思是有個target gene想要knock down
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07/21 08:35, , 4F
但我不太確定要在哪一株cell line做knock down
07/21 08:35, 4F
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07/21 08:36, , 5F
其實應該做個western看看哪株cell line有表現我要knock
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07/21 08:36, , 6F
down的gene，但我們lab太多cell line了....所以我想說不知
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07/21 08:37, , 7F
能不能先找個database看看，就不用這麼麻煩了
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07/21 08:44, , 8F
07/21 08:44, 8F
推
07/21 09:33, , 9F
樓上的網站也大部分是normal tissue
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07/21 09:34, , 10F
cancer cell-line的話 很少看到有提供expression的
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07/21 09:35, , 11F
我們自己是有分析的cell-line expression
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推
07/21 16:59, , 12F
用nci的database？
07/21 16:59, 12F
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07/22 12:10, , 13F
biogps有cancer cell line的expression profile
07/22 12:10, 13F
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