[求救] 請問如何在一些序列中找到consensus sequence?

看板Biotech作者 (...)時間14年前 (2010/05/24 12:14), 編輯推噓3(3推 0噓 14→)
留言17則, 4人參與, 最新討論串1/1
想請問我想在十個約30mer的序列中找到consensus sequence 例如 序列一 ： acggaggaccuuaug accca aacauuagac 序列二 ： cauugg accca gugguaggaaucugccuuc 如何在這兩個序列中找到accca是在這兩個序列中都有出現的序列？？ 不知道有沒有生資的強者可以幫忙～～ 謝謝謝謝！！ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 120.126.97.10
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ClastalW2
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推
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bioedit可以
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請問bioedite該如何操作呢？我只會clutalW Multiple
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alignment 卻跑不出我想要的把accca排在一起
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推
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上google 打 bioedit 就有一篇網誌專門講他了 !!
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雖然是很初淺的，但是 應該也夠用了
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謝謝樓上提供的方法但是原本就用過這方法還是沒辦法跑
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出accca的結果～
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推
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利用土法煉鋼 直接把序列複製 用搜尋去找吧~
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找完之後 在自己推齊~
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1. 先複製 accca
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2. 再到你要的序列旁 利用 ctrl+f 將序列貼上 他就會搜尋
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恩...我貼的這兩個序列是例子～之後我所拿到的十個序列
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中，有什麼保留性的序列是未知的，所以土法也沒辦法用
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能夠請問一樓ClastalW2嗎？ 我只有搜尋到ClustalW2
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但是還是不太會用 ^^"
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