[閒聊] 關於同種間品系分類鑑定的方式有哪些呢?
小弟目前在做植物品系分類的研究
收集資料顯示分子標記的方式很多種
也自己整理比較過:
優點 缺點
RAPD 省錢、快速、不需知道DNA序列 引子短,重現性低
AFLP 較RAPD有效偵測DNA多型性 耗時、花錢
SCAR 必須知道DNA序列
CAPs PCR後,需要酵素截切
ISSR 不需知道DNA序列,
較RAPD有較高且穩定的重現性
FISSR 比ISSR更多的重現性 需要花更長的時間跑膠,
以及使用大量螢光dNTP和polyacrylamide
SNP 定序後的多型性太高,造成分析上的困難,
因此較ISSR耗時
不曉得板上的大大可否再幫我加強一下上述的比較,
亦或者是有其他好用的方法可以提出!
像是使用cpDNA、mtDNA鑑定,或是rRNA(好像是同屬不同種間的分類)的比較
因為我做的植物,根據前人以地理環境區分營養系至少有200種以上!!
所以想要考量金錢時間下到找相對精確的方式做區分之法!!
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