[求救] 請問該用TCA或acetone沉澱蛋白?
各位前輩
最近操作蛋白沉澱發生了一些問題,想求助各位前輩
我分別用過TCA沉澱與acetone沉澱,雖然兩者皆可以壓到wild type protein,
但在其他WB中預期會看見的bend卻沒看見,更奇怪的是,TCA沉澱看到的bend
在acetone沉澱結果中卻不見了,因此想請問各位前輩的看法
如果作法上有什麼瑕疵的,也請前輩們指正,謝謝!
我的蛋白構築在invitrogen的pSecTag2 vector中
transfect至cos-7細胞表現後,蛋白會被分泌到medium中
我先嘗試以TCA方法沉澱,
medium加入final 20% TCA後,放置冰上10分鐘以沉澱蛋白,14k rpm, 5 min離心
將pellet以acetone wash 兩次後,以95度烘乾,加入pierce的
M-PER Mammalian Protein Extraction Reagent 回溶pellet,因無法完全溶解
因此離心後取上清液定量後進行WB
後因TCA沉澱之pellet太難回溶,想改以acetone沉澱
參考的步驟是來自pierce的protocol
http://www.piercenet.com/files/TR0049-Acetone-precipitation.pdf
medium加入final 80% 冰的acetone後,置於-30度5小時,以14k rpm, 10 min離心
將pellet wash後,以50度烘乾,加入pierce的
M-PER Mammalian Protein Extraction Reagent 回溶pellet,
雖然以acetone沉澱得到許多pellet,但是卻無法完全溶解,因此同樣是離心後
取上清液定量後進行WB
有想到幾點
想請問,關於acetone沉澱中acetone final 80%,是否有需要改低一點?
還有就是TCA沉澱與acetone沉澱得到的蛋白質或是得到的pellet內含物是否會有所不同?
例如非蛋白質的雜質較多...等
如果還有其他思慮不週的部份,還請各位前輩指出,謝謝!
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.72.94
推
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