[求救] 請問該用TCA或acetone沉澱蛋白?

看板Biotech作者 (S)時間14年前 (2009/12/31 11:42), 編輯推噓1(1013)
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各位前輩 最近操作蛋白沉澱發生了一些問題,想求助各位前輩 我分別用過TCA沉澱與acetone沉澱,雖然兩者皆可以壓到wild type protein, 但在其他WB中預期會看見的bend卻沒看見,更奇怪的是,TCA沉澱看到的bend 在acetone沉澱結果中卻不見了,因此想請問各位前輩的看法 如果作法上有什麼瑕疵的,也請前輩們指正,謝謝! 我的蛋白構築在invitrogen的pSecTag2 vector中 transfect至cos-7細胞表現後,蛋白會被分泌到medium中 我先嘗試以TCA方法沉澱, medium加入final 20% TCA後,放置冰上10分鐘以沉澱蛋白,14k rpm, 5 min離心 將pellet以acetone wash 兩次後,以95度烘乾,加入pierce的 M-PER Mammalian Protein Extraction Reagent 回溶pellet,因無法完全溶解 因此離心後取上清液定量後進行WB 後因TCA沉澱之pellet太難回溶,想改以acetone沉澱 參考的步驟是來自pierce的protocol http://www.piercenet.com/files/TR0049-Acetone-precipitation.pdf medium加入final 80% 冰的acetone後,置於-30度5小時,以14k rpm, 10 min離心 將pellet wash後,以50度烘乾,加入pierce的 M-PER Mammalian Protein Extraction Reagent 回溶pellet, 雖然以acetone沉澱得到許多pellet,但是卻無法完全溶解,因此同樣是離心後 取上清液定量後進行WB 有想到幾點 想請問,關於acetone沉澱中acetone final 80%,是否有需要改低一點? 還有就是TCA沉澱與acetone沉澱得到的蛋白質或是得到的pellet內含物是否會有所不同? 例如非蛋白質的雜質較多...等 如果還有其他思慮不週的部份,還請各位前輩指出,謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.72.94

12/31 15:51, , 1F
那就合併兩者,TCA用acetone溶,最後一次離心時轉速不用
12/31 15:51, 1F

12/31 15:52, , 2F
太快,都已經沈澱了,10000rpm以下就夠了,所以縮短時間
12/31 15:52, 2F

12/31 15:53, , 3F
這樣pellet就不會太硬,還有沈澱一般都2小時以上吧?
12/31 15:53, 3F

12/31 19:11, , 4F
[DTT+lysate]+[aceton+TCA]我的經驗很好溶(condi medium)
12/31 19:11, 4F

12/31 19:12, , 5F
但是我吸乾或晾乾到沒有液滴就準備溶了 不然太乾
12/31 19:12, 5F

12/31 19:13, , 6F
乾燥前是先acetone洗3再酒精洗3 (印象中)
12/31 19:13, 6F

12/31 21:40, , 7F
目前實驗室是用買來已經溶好的TCA,請問該怎麼再加入
12/31 21:40, 7F

12/31 21:42, , 8F
acetone呢?沈澱需要放到-20度之類的嗎?謝謝!
12/31 21:42, 8F

12/31 21:46, , 9F
不好意思!請問condi medium是什麼?我google找不到..
12/31 21:46, 9F

12/31 21:54, , 10F
有看到missoul大之前的推文說是用CHAPS/urea/thiourea
12/31 21:54, 10F

12/31 21:54, , 11F
回溶的,請問您說的condi medium是指這個嗎?
12/31 21:54, 11F

12/31 21:56, , 12F
若是,請問配方及濃度我該怎樣才查的到呢?謝謝!
12/31 21:56, 12F

01/01 15:49, , 13F
沒有要跑2DE的話把CHAPS換成SDS效果應該更好,TCA我們是
01/01 15:49, 13F

01/01 15:50, , 14F
固態的
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