[求救] cPCR有東西, 卻養不出小量

看板Biotech作者 (Magic Ha)時間14年前 (2009/12/07 23:51), 編輯推噓5(5012)
留言17則, 6人參與, 5年前最新討論串1/1
發問時請注意,若是要問實驗相關的問題,請將實驗的步驟、所用的條件大致列出 以方便板友幫您追蹤問題 ----請將上列注意事項以 ctrl + k 刪除後開始編輯文章---- 1. 用primer夾出target gene,跑 2% agarose gel. 確定target gene有被放大. 2. 做T/A clone, 使用promega的系統, inser(8.6ng),vector(25ng) (inser:~1.8kb) (pGEM-T Easy Vector system, 帶有anti-ampicillin的gene) 3. ligation overnight後, transform到DH5a裡(heat shock:90sec, on ice: 30mins) 4. 加入500ul LB後, 於37度烘箱搖1hr. 之後取250ul塗盤(ampiillin: 100ug/ml) 5. 37度烘箱中培養14~16hr後, 挑菌做cPCR, 養小量(ampicillin: 100ug/ml) 6. 37度烘箱中搖14~16hr. 菌液依然清澈透明 "Orz 問題: 確定cPCR有我要的inser(表示有plasmid在), 可是卻養不出小量(菌液清澈透明)? 已經確定PCR system沒有被污染, ampicillin也是新鮮的. P.S 第一次PO文, 有哪裡講不清楚的請提出, 我會再補上. 先謝謝各位了! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.77.148 ※ 編輯: chaunen 來自: 140.129.77.148 (12/07 23:54) ※ 編輯: chaunen 來自: 140.129.77.148 (12/07 23:57)

12/08 01:22, , 1F
Amp plate可否做control看是否抗生素真的有效?
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12/08 01:24, , 2F
另外 PCR有做negative control確定沒有template情況下
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12/08 01:24, , 3F
也沒有產物嗎
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12/08 10:55, , 4F
ligation, heat shock跟冷卻的時間好像都有點久..
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12/08 10:57, , 5F
我之前做是ligation 30min,heat shock 45s, ice 5min
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12/08 11:00, , 6F
還有polymerase是用什麼? 怎麼知道尾端有沒有接上A
12/08 11:00, 6F

12/08 12:52, , 7F
cPCR偽陽性高 如果我是你的話 重做比較快...
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12/08 19:17, , 8F
同意一樓,先確認你的Amp plate效果是否還在
12/08 19:17, 8F

12/14 01:48, , 9F
結果真的是plate amp失效 cPCR的negtive control也做了
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12/14 01:49, , 10F
cPCR的偽陽性還真不少 XD 我太相信cPCR了ˊˋ
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12/14 01:51, , 11F
抽出來的plasmid好像會有aggregate的問題
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12/14 01:51, , 12F
size約在8~10K (vector + inser大約5K)
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12/14 01:52, , 13F
不過切下inser的話, 又可以看到正常的band
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12/14 01:53, , 14F
vector:3K inser:1.8K
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12/14 01:54, , 15F
不論如何還是謝謝大家! (我也太晚回了=.=")
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11/11 01:52, , 16F
還有polymeras https://daxiv.com
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01/03 17:03, 5年前 , 17F
結果真的是plate http://yofuk.com
01/03 17:03, 17F
文章代碼(AID): #1B7IHeFH (Biotech)